269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0919 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0919  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 116 aa  225  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0311867  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1436  large-conductance mechanosensitive channel  83.9 
 
 		 120 aa  174  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000693237  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1409  large-conductance mechanosensitive channel  83.9 
 
 		 120 aa  174  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000924927  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  57.02 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  57.85 
 
 		 127 aa  126  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  51.59 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  50.79 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  46.51 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  46.51 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  46.51 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  46.51 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  46.51 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  46.51 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  46.51 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  46.51 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  58.06 
 
 		 132 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  44.62 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  46.51 
 
 		 133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  45.38 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  48.84 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  45.74 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  46.51 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  46.51 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  47.33 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  45.38 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  46.51 
 
 		 136 aa  110  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  48.06 
 
 		 136 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  48.06 
 
 		 136 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  48.06 
 
 		 136 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  48.06 
 
 		 136 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  46.15 
 
 		 135 aa  110  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  47.66 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  45.74 
 
 		 136 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  45.74 
 
 		 136 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  46.51 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  44.96 
 
 		 136 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  45.74 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  41.86 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  45.74 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  45.74 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  46.62 
 
 		 139 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  50.37 
 
 		 132 aa  107  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  45.8 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  44.7 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  44.96 
 
 		 148 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  44.62 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  46.92 
 
 		 137 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  46.92 
 
 		 137 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  50.38 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  46.97 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  51.61 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  47.29 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  51.61 
 
 		 132 aa  104  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  50.77 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  50.77 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  50.77 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  47.76 
 
 		 137 aa  104  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  50.77 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  51.2 
 
 		 133 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  45.38 
 
 		 138 aa  103  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  45.67 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  44.09 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  48.46 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  45.8 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1242  large conductance mechanosensitive channel protein  46.51 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  47.06 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  43.61 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1256  large conductance mechanosensitive channel protein  45.38 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  44.44 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  48.31 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  42.14 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  44.6 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3312  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  46.83 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3679  large-conductance mechanosensitive channel  44.96 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3777  large-conductance mechanosensitive channel  44.96 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3607  large-conductance mechanosensitive channel  44.96 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.256612 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3714  large-conductance mechanosensitive channel  44.96 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.401904 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3606  large-conductance mechanosensitive channel  44.96 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0494582  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0871  large conductance mechanosensitive channel protein  47.54 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  44.78 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  41.73 
 
 		 139 aa  100  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  44.78 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  42.34 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  43.57 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  42.65 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  43.57 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  48.31 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  41.18 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  43.57 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2194  large conductance mechanosensitive channel protein  51.94 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  43.57 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  43.57 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  43.57 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  43.57 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>