45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0079 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0079  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  264  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1966  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.08 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.81 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172223  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2808  hypothetical protein  23.58 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.193155  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0821  PhnB  24.37 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.697447  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1273  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.14 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.174094 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1175  glyoxalase family protein  23.21 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1934  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.82 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.358523  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2584  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.03 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.91802  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1424  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.53 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.805233  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1204  PhnB protein  22.76 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3316  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.44 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.918478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3966  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.44 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  0.267495 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0482  hypothetical protein  25.83 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226703 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3991  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.31 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.463262  normal  0.542881 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4762  hypothetical protein  25.83 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2509  hypothetical protein  24.64 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4779  hypothetical protein  25 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4753  hypothetical protein  25 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4780  hypothetical protein  23.85 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.17 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4542  hypothetical protein  25 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0952662  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3277  putative glyxalase protein  21.74 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.35593  normal  0.397302 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4378  PhnB protein  25 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4895  hypothetical protein  25 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00185304  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2362  hypothetical protein  25.36 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4388  PhnB protein  25 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0567187  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4058  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.59 
 
 		 163 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0107  hypothetical protein  24.81 
 
 		 159 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.549372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1265  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.31 
 
 		 157 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0637  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.2 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0585863 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4025  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.59 
 
 		 163 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2320  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2105  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.2 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00223663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2927  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.4 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219194  normal  0.368247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4475  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.33 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5247  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.46 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554812  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2492  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61410  hypothetical protein  30.23 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.510351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2290  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.62 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000395035  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5290  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.19 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4772  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2762  hypothetical protein  20.34 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2770  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.38 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00372425  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3520  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 145 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.85303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>