61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0049 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0049  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  149  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0433  hypothetical protein  72.29 
 
 
83 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0423  hypothetical protein  72.29 
 
 
83 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.407263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2694  transglycosylase-associated protein  65.79 
 
 
80 aa  97.4  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.975215  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1980  transglycosylase-associated protein  64.47 
 
 
82 aa  97.1  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3381  hypothetical protein  61.84 
 
 
82 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.470225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1676  Transglycosylase-associated protein  54.55 
 
 
84 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0899  transglycosylase-associated protein  56.1 
 
 
83 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1082  hypothetical protein  54.88 
 
 
83 aa  87  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1155  hypothetical protein  56.1 
 
 
83 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1028  hypothetical protein  56.1 
 
 
83 aa  87  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4274  hypothetical protein  56.1 
 
 
83 aa  87  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.126831  hitchhiker  0.00313613 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1064  hypothetical protein  56.1 
 
 
83 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6423e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0988  hypothetical protein  56.1 
 
 
83 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0909  hypothetical protein  56.1 
 
 
83 aa  87  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000195971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0892  hypothetical protein  56.1 
 
 
83 aa  87  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0924  hypothetical protein  56.1 
 
 
83 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3356  hypothetical protein  55.26 
 
 
82 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3162  hypothetical protein  55.26 
 
 
82 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00262305  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3146  hypothetical protein  55.26 
 
 
82 aa  82  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3381  hypothetical protein  55.26 
 
 
82 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3382  hypothetical protein  55.26 
 
 
82 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0674128  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3411  hypothetical protein  55.26 
 
 
82 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627369  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3056  hypothetical protein  55.26 
 
 
82 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000292001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1870  hypothetical protein  55.26 
 
 
82 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3084  transglycosylase-associated protein  54.1 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00138083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2903  hypothetical protein  63.75 
 
 
80 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.675499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2342  hypothetical protein  60 
 
 
80 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.327817  hitchhiker  0.00107333 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2641  hypothetical protein  59.76 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.271706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2926  hypothetical protein  61.25 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000491326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2692  hypothetical protein  61.25 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00157734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2938  hypothetical protein  61.25 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2618  hypothetical protein  61.25 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.434987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2890  hypothetical protein  61.25 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011999 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2887  hypothetical protein  61.25 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.471323  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0866  hypothetical protein  42.68 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0055  hypothetical protein  43.84 
 
 
79 aa  65.5  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1716  Transglycosylase-associated protein  55.84 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1629  transglycosylase-associated protein  44.87 
 
 
83 aa  60.8  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0033  hypothetical protein  48.15 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1804  Transglycosylase-associated protein  39.76 
 
 
91 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0431301  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1354  hypothetical protein  44.44 
 
 
87 aa  52  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.972774  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0861  hypothetical protein  41.07 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  39.24 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0056  hypothetical protein  42.55 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  32.91 
 
 
90 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  39.24 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0097  hypothetical protein  39.71 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.126932  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  36.9 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1780  Transglycosylase-associated protein  45.78 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  41.25 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  32.1 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2149  hypothetical protein  48.21 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.673997  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0069  hypothetical protein  44.64 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  37.18 
 
 
83 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  38.75 
 
 
83 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1959  hypothetical protein  51.28 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.352409  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  34.62 
 
 
83 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  34.52 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  36.25 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1141  hypothetical protein  41.18 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00570897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>