More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0027 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0027  ABC transporter, ATP-binding protein, truncation  100 
 
 		 84 aa  166  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0399  ABC transporter related  58.67 
 
 		 280 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00135528  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0409  ABC transporter related  58.67 
 
 		 280 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00250472  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0764  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  40.28 
 
 		 249 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000201929  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 		 283 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1982  ABC transporter ATP-binding protein  45.33 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2130  ABC transporter ATP-binding protein  45.33 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.718107  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  40.79 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  40.22 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  39.73 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2163  ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 		 288 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  45.33 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  40.91 
 
 		 876 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  39.73 
 
 		 331 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  38.46 
 
 		 866 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0414  sugar transport ATP-binding protein  57.41 
 
 		 528 aa  60.1  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  42.86 
 
 		 254 aa  60.1  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  40.58 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  33.77 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 555 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  35.71 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2713  ABC transporter related  45.31 
 
 		 510 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2276  ABC transporter related  42.65 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  43.75 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6100  ABC transporter related  50 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  47.54 
 
 		 250 aa  58.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 508 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0301  ABC transporter related  38.81 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000133635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  33.75 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  41.27 
 
 		 285 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0774  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 244 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.083835  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  36 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3313  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.77 
 
 		 502 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571004  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.27 
 
 		 551 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  46.03 
 
 		 641 aa  57.4  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2824  ABC transporter related  41.18 
 
 		 302 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  39.13 
 
 		 252 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4051  ABC transporter related  52 
 
 		 495 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.463588 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4468  ABC transporter related  44.26 
 
 		 258 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0948  ABC transporter ATP-binding protein  43.08 
 
 		 236 aa  57.4  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0386594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.54 
 
 		 555 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  39.13 
 
 		 252 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 293 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0591  ABC transporter related  30.59 
 
 		 321 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.54 
 
 		 555 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0822  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.54 
 
 		 555 aa  57  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  42.03 
 
 		 501 aa  57  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0043  ABC transporter related  41.18 
 
 		 240 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.59 
 
 		 266 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  45.59 
 
 		 256 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2632  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.06 
 
 		 564 aa  56.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.174324  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0886  ABC transporter, ATP-binding protein  42.37 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00203373  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  40.28 
 
 		 501 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  37.68 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  37.68 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  43.94 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  38.24 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  43.94 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  47.46 
 
 		 600 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  41.43 
 
 		 579 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1238  ABC transporter related  38.57 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1097  ATPase  42.86 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  40.28 
 
 		 501 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  37.68 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  44.12 
 
 		 264 aa  57  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1851  ABC transporter related  40 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28249  normal  0.201191 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  33.77 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2891  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.33 
 
 		 559 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.315278  decreased coverage  0.00408651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6452  ABC transporter related  44.26 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242945  hitchhiker  0.00000000013966 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  35.71 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  38.1 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0007  ABC transporter related  34.62 
 
 		 435 aa  56.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5042  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  39.68 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.650295  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  36.14 
 
 		 591 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6847  ABC transporter related  44.44 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  36.62 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  37.68 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1407  ABC transporter related  41.54 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.815122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  40.28 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6411  ABC transporter related  41.27 
 
 		 498 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000000554602  normal  0.729468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  39.19 
 
 		 563 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4105  ABC transporter-like  41.43 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479165 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  45.45 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0825  ATPase  52.83 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.465318  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  36.62 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1927  phosphonate ABC transporter ATP-binding  38.81 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.68 
 
 		 551 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  37.14 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  43.48 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0372  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.62 
 
 		 556 aa  55.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  37.68 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2890  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.58 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0336941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  39.39 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  36.99 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  40.3 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08841  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  52.83 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1380  ABC transporter related  41.54 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00611293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>