35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2009 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG2009  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  177  2.9999999999999997e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0661805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3894  prevent-host-death family protein  27.27 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0028  prevent-host-death protein  30.95 
 
 
86 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0227799  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1939  prevent-host-death family protein  30.95 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4301  prevent-host-death family protein  36.78 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0123254  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1927  prevent-host-death family protein  29.76 
 
 
83 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00504779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2293  prevent-host-death family protein  28.57 
 
 
83 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0178348 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4023  prevent-host-death family protein  28.57 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0390  prevent-host-death family protein  23.81 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0433  prevent-host-death protein  29.76 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0794  prevent-host-death family protein  26.19 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2433  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2481  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041466  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2089  RelB  30.59 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.674522  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0311  prevent-host-death family protein  29.49 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1639  prevent-host-death family protein  28.57 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1214  antitoxin YefM  28.57 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2309  antitoxin YefM  28.57 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.516264  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2156  antitoxin YefM  28.57 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4434  prevent-host-death family protein  27.38 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.318074  normal  0.388841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1845  hypothetical protein  26.19 
 
 
83 aa  43.5  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745967  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5409  prevent-host-death family protein  28.57 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4877  prevent-host-death family protein  28.57 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1751  prevent-host-death protein  35.38 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4634  prevent-host-death protein  27.38 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374921  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3489  prevent-host-death protein  28.57 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00502392  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3905  prevent-host-death family protein  36.21 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542624  normal  0.0844002 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0247  prevent-host-death family protein  25 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0844  prevent-host-death protein  28.05 
 
 
86 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0811736 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0554  antitoxin  29.76 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0694482  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4765  prevent-host-death family protein  27.38 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1208  prevent-host-death protein  28.24 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1101  prevent-host-death protein  30.43 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01350  prevent-host-death family protein  25.58 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4120  hypothetical protein  27.59 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>