36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2539 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2539  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  223  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0864  protein of unknown function DUF107  40 
 
 
447 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0908581  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1013  protein of unknown function DUF107  34.95 
 
 
455 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  41.56 
 
 
510 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1623  hypothetical protein  39.73 
 
 
464 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.475533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1336  hypothetical protein  40 
 
 
464 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.965224  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4951  protein of unknown function DUF107  39.56 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125072  normal  0.546371 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0871  protein of unknown function DUF107  34.65 
 
 
444 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000176034  normal  0.0484156 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0696  protein of unknown function DUF107  42.25 
 
 
105 aa  47  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  34.65 
 
 
455 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1624  hypothetical protein  28.85 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0558  hypothetical protein  29.81 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  38.46 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  32.99 
 
 
423 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  43.04 
 
 
488 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  33.33 
 
 
458 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1306  NfeD protein  41.43 
 
 
443 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0289  hypothetical protein  29.81 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285754  normal  0.174624 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  26.26 
 
 
463 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  40.79 
 
 
433 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  38.36 
 
 
438 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4390  protein of unknown function DUF107  40.2 
 
 
467 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  42.03 
 
 
453 aa  43.5  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1082  hypothetical protein  33.33 
 
 
546 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409123  hitchhiker  0.00827512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0037  nodulation efficiency protein NfeD  31.5 
 
 
452 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00280773  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1959  membrane-bound serine protease (ClpP class), putative  41.56 
 
 
470 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3654  hypothetical protein  40.95 
 
 
524 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12030  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  38.89 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0225473  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5652  protein of unknown function DUF107  33.96 
 
 
522 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.995494 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1169  protein of unknown function DUF107  27.27 
 
 
434 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0123968 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1477  hypothetical protein  40.91 
 
 
436 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135375  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  41.07 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4906  hypothetical protein  39.42 
 
 
528 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.349599 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4387  hypothetical protein  38 
 
 
525 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98413  normal  0.116694 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  38.57 
 
 
430 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0770  hypothetical protein  22.22 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>