More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2471 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2471  ABC transporter related  100 
 
 
288 aa  539  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.61 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  39.35 
 
 
290 aa  205  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.41 
 
 
286 aa  205  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  35.82 
 
 
280 aa  202  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  37.86 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  37.86 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0246  ABC transporter related  42.8 
 
 
283 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  39.84 
 
 
287 aa  194  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 
281 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  37.15 
 
 
286 aa  185  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  36.9 
 
 
303 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.1 
 
 
293 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0875323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0171  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.1 
 
 
293 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000671668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  36.5 
 
 
299 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.78 
 
 
281 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2150  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.25 
 
 
280 aa  176  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.48 
 
 
277 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2301  putative ABC transporter  41.84 
 
 
289 aa  175  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00300112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5165  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.75 
 
 
293 aa  175  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000192836  hitchhiker  0.000000000000102962 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.43 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0161  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.75 
 
 
293 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  38.28 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1802  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.88 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.135758  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.75 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.75 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.168047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.75 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000645208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  36.33 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.83 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.11 
 
 
288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0317  ABC transporter related  42.23 
 
 
283 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000872921  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.86 
 
 
281 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1701  ABC transporter related  40.22 
 
 
292 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.25 
 
 
278 aa  171  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.75 
 
 
293 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.16 
 
 
285 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.16 
 
 
285 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0137  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.23 
 
 
290 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.45 
 
 
277 aa  169  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0153  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.04 
 
 
293 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1113499999999999e-42 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0289  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.46 
 
 
288 aa  169  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0412656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.11 
 
 
277 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0829  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  37.11 
 
 
292 aa  168  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.773526  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.55 
 
 
281 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.87 
 
 
284 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  37.31 
 
 
398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  34.17 
 
 
278 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
277 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.04 
 
 
293 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  42.16 
 
 
325 aa  165  8e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44 
 
 
257 aa  165  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.94 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  38.35 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0141  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.06 
 
 
291 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000352159  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1418  ABC transporter related  37.69 
 
 
287 aa  163  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 
630 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.47 
 
 
541 aa  162  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24060  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.11 
 
 
278 aa  162  8.000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.569983  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.46 
 
 
243 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 
249 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.18 
 
 
264 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24070  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.15 
 
 
305 aa  161  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.850026  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.27 
 
 
411 aa  161  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.94 
 
 
256 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.63 
 
 
277 aa  161  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0319  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.87 
 
 
288 aa  161  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.2074000000000003e-19 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  34.72 
 
 
281 aa  161  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.53 
 
 
253 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.14 
 
 
244 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.74 
 
 
280 aa  160  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.02 
 
 
279 aa  159  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12570  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.8 
 
 
344 aa  159  6e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1948  cobalt ABC transporter ATPase  35.02 
 
 
289 aa  159  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.701043  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.08 
 
 
402 aa  158  8e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  41.5 
 
 
242 aa  158  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  36.13 
 
 
282 aa  158  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  42.28 
 
 
252 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.46 
 
 
293 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000430525  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl153  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.72 
 
 
315 aa  157  2e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  36.96 
 
 
273 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.81 
 
 
440 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.4 
 
 
276 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  36.96 
 
 
273 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  36.68 
 
 
605 aa  156  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  39.51 
 
 
255 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  39.09 
 
 
255 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0288  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.09 
 
 
277 aa  156  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337056  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1152  ABC transporter related protein  44.84 
 
 
279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00740539  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2249  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.73 
 
 
269 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2290  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.73 
 
 
269 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12560  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.93 
 
 
283 aa  155  7e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  37.6 
 
 
568 aa  155  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.63 
 
 
270 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2125  ABC transporter related  47.49 
 
 
272 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0679248  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.04 
 
 
395 aa  154  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.24 
 
 
403 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  33.88 
 
 
456 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  32.72 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.71 
 
 
273 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>