8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1843 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0087    100 
 
 		 872 bp  1729    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1843    100 
 
 		 872 bp  1729    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  85.71 
 
 		 477 bp  404  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  88.92 
 
 		 378 bp  369  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2507  transposase  88.32 
 
 		 378 bp  353  5e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2513  putative transposase  82.04 
 
 		 387 bp  186  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1859    90.74 
 
 		 492 bp  67.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000305426  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  96.43 
 
 		 762 bp  48.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>