241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1743 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1743  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 267 aa  506  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00781757  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  33.17 
 
 		 286 aa  99  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  30.87 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 		 293 aa  94.7  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 277 aa  92.8  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  31.94 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  28.84 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  30.98 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  34.1 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  29.62 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  30.47 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  33.52 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  31.1 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  31.25 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  30.93 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  30.14 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  27.53 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3387  multidrug ABC transporter inner membrane protein  27.59 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  33.45 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  30.91 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  26.46 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.9 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  32.62 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1342  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.333729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 267 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  26.83 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  26.83 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  34.06 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  31.95 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.46 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  25.61 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  25.61 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  25.61 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  26.02 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  25.61 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  26.02 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3120  multidrug ABC transporter inner membrane protein  26.38 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.561291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  25.61 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3261  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0655  ABC-2 type transporter  29.87 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.78 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.86 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  32.18 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  31.07 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  30.77 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  32.26 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  29.66 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  26.53 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2873  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  26.53 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.9 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2858  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  26.53 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  29.36 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  26.67 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.02 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.68 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.64 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 290 aa  62  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  31.22 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>