19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0562 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0562  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  657    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1941  hypothetical protein  44.09 
 
 
320 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.944736  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2683  sulfotransferase-like protein  45.45 
 
 
308 aa  249  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1483  sulfotransferase domain-containing protein  39.74 
 
 
358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1177  sulfotransferase  36.39 
 
 
325 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3976  hypothetical protein  39.68 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8599  hypothetical protein  38.14 
 
 
319 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552994  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3147  hypothetical protein  36.04 
 
 
447 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130118  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5203  hypothetical protein  34.59 
 
 
325 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1933  sulfotransferase-like protein  33.04 
 
 
347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.345912  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4571  putative enzyme  29.36 
 
 
312 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0381  hypothetical protein  26.75 
 
 
305 aa  99.8  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.593972  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18740  hypothetical protein  29.48 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.856365  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4096  sulfotransferase  24.37 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0437  hypothetical protein  23.29 
 
 
329 aa  63.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.474392  normal  0.018516 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25581  hypothetical protein  24.74 
 
 
365 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0203  hypothetical protein  24.58 
 
 
284 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1798  hypothetical protein  27.53 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  24.51 
 
 
530 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>