16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0046 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0046  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  526  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2715  hypothetical protein  37.55 
 
 
279 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0442027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8914  hypothetical protein  36.81 
 
 
192 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0158  hypothetical protein  33.55 
 
 
313 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.494039  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0535  hypothetical protein  29.81 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518716  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5146  hypothetical protein  27.81 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0914  hypothetical protein  27.08 
 
 
269 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.320599  normal  0.183978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0712  hypothetical protein  28.43 
 
 
214 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.846862  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2966  hypothetical protein  20.72 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207122  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4037  hypothetical protein  32.9 
 
 
222 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  normal  0.0313625 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2642  hypothetical protein  31.02 
 
 
348 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227715  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2973  hypothetical protein  21.68 
 
 
349 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.834936  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5626  hypothetical protein  25.79 
 
 
337 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154259  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2719  hypothetical protein  21.24 
 
 
349 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0920499  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2670  hypothetical protein  20.72 
 
 
349 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2927  hypothetical protein  21.24 
 
 
349 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.133656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>