23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_R0014 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_4301  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.640502  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0029  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0044  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0970337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0046  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309259  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0037  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000268992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0041  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0019  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>