186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3737 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3737  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  312  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  49.5 
 
 		 400 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5073  hypothetical protein  46.51 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0094  Phage integrase  47.5 
 
 		 449 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000297047  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  36.94 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  44.68 
 
 		 452 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  36.54 
 
 		 451 aa  71.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  44.19 
 
 		 413 aa  70.5  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  40.23 
 
 		 452 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0686  integrase family protein  41.98 
 
 		 472 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  45.33 
 
 		 457 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  45.33 
 
 		 457 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  42.22 
 
 		 417 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  40.96 
 
 		 451 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  31.73 
 
 		 451 aa  63.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  35.42 
 
 		 424 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  43.84 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  41.75 
 
 		 420 aa  62  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1526  phage integrase  36.25 
 
 		 440 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  39.73 
 
 		 398 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  34.07 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3805  integrase family protein  40.28 
 
 		 450 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  31.73 
 
 		 393 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  30.19 
 
 		 384 aa  57.4  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2717  Phage integrase  34.17 
 
 		 479 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3340  phage integrase family protein  42.19 
 
 		 452 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.58116  normal  0.0453376 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  38.55 
 
 		 439 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  35.24 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  41.54 
 
 		 400 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  45.16 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  38.78 
 
 		 439 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  27.88 
 
 		 411 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  27.88 
 
 		 397 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  28.85 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  33.7 
 
 		 463 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  37.14 
 
 		 410 aa  55.1  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3724  putative integrase protein  35.87 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1433  transposase, IS4 family protein  34.38 
 
 		 405 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  42.62 
 
 		 389 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  38.67 
 
 		 414 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  29.67 
 
 		 406 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  35.44 
 
 		 412 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  31.13 
 
 		 433 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  36.45 
 
 		 444 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  28.07 
 
 		 426 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  34.78 
 
 		 400 aa  50.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1997  site specific recombinase  35.42 
 
 		 279 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  35.71 
 
 		 399 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  34.78 
 
 		 401 aa  50.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  38.64 
 
 		 400 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  30.39 
 
 		 399 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  38.46 
 
 		 432 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  38.64 
 
 		 400 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  32.35 
 
 		 500 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  30.1 
 
 		 420 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  37.97 
 
 		 401 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4662  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.1 
 
 		 334 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  32.67 
 
 		 423 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  30.1 
 
 		 421 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  33.61 
 
 		 399 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2399  hypothetical protein  32 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.0250128 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  27.93 
 
 		 410 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1340  phage integrase family protein  32.94 
 
 		 487 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal  0.929089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  32.61 
 
 		 399 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  32.29 
 
 		 643 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  42.03 
 
 		 408 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  31.07 
 
 		 419 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1213  phage integrase family protein  30.69 
 
 		 411 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550435  normal  0.724829 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  33.33 
 
 		 411 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.13 
 
 		 420 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1977  phage integrase family protein  31.76 
 
 		 617 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  31.78 
 
 		 467 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  29.91 
 
 		 449 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3414  hypothetical protein  44.12 
 
 		 202 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1693  integrase family protein  30.34 
 
 		 423 aa  47  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0807  integrase protein  35.96 
 
 		 181 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2408  phage-related integrase  33.33 
 
 		 206 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00105004  decreased coverage  0.00000355943 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1309  integrase family protein  29.17 
 
 		 385 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00894189  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  36.25 
 
 		 441 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  39.44 
 
 		 391 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0310  integrase  34.62 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0285947  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3582  integrase  29.17 
 
 		 397 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010448 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2408  integrase (int)  31.76 
 
 		 617 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.71715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  32.88 
 
 		 410 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  36.73 
 
 		 425 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  33.8 
 
 		 394 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  28.57 
 
 		 420 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  37.88 
 
 		 402 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  29.75 
 
 		 405 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3372  integrase family protein  36.11 
 
 		 601 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  33.75 
 
 		 418 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2383  integrase family protein  37.33 
 
 		 427 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  33.78 
 
 		 393 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  34.48 
 
 		 400 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  33.75 
 
 		 418 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3701  phage integrase  39.71 
 
 		 276 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  33.8 
 
 		 394 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  36.92 
 
 		 427 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  29.47 
 
 		 448 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3466  integrase family protein  30.69 
 
 		 644 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>