More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3149 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3503  sugar ABC transporter ATPase  98.98 
 
 		 491 aa  958    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3149  ABC transporter related  100 
 
 		 491 aa  968    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180816  normal  0.205062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4472  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  47.55 
 
 		 511 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4402  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  47.55 
 
 		 511 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4320  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  47.55 
 
 		 511 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4290  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  47.55 
 
 		 511 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.293045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4405  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  47.55 
 
 		 511 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1659  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  48.26 
 
 		 511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2145  ABC transporter related  48.06 
 
 		 511 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2133  ABC transporter related protein  48.94 
 
 		 511 aa  444  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0375585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1595  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  47.85 
 
 		 511 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3650  ABC transporter related  46.96 
 
 		 527 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3521  autoinducer AI-2 ABC transporter, ATP binding protein  46.96 
 
 		 527 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2126  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  47.44 
 
 		 511 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0858  autoinducer AI-2 ABC transporter ATP binding protein  46.96 
 
 		 527 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0051  ABC transporter, ATP-binding, sugar transport  43.2 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000186076  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3536  ABC transporter related  48.07 
 
 		 495 aa  416  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3017  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 		 493 aa  358  9e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2716  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.89 
 
 		 493 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3015  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.1 
 
 		 493 aa  352  8e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0481734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2979  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.27 
 
 		 493 aa  348  9e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2766  ribose ABC transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 496 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2978  ribose ABC transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 496 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.72 
 
 		 503 aa  347  4e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  43.46 
 
 		 503 aa  346  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2696  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.47 
 
 		 493 aa  346  6e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2975  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.42 
 
 		 493 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000730474 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  42.54 
 
 		 519 aa  342  8e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2772  ABC transporter related  38.43 
 
 		 497 aa  342  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0913343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  42.95 
 
 		 507 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2263  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 493 aa  340  4e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  38.9 
 
 		 492 aa  339  5.9999999999999996e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.89 
 
 		 495 aa  338  9e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  41.53 
 
 		 512 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  40.85 
 
 		 513 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  42.51 
 
 		 506 aa  336  7e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  39.88 
 
 		 511 aa  335  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  40.52 
 
 		 504 aa  333  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  41.9 
 
 		 519 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  41.47 
 
 		 516 aa  332  7.000000000000001e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  39.46 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  40.63 
 
 		 524 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  42.62 
 
 		 503 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0544  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.72 
 
 		 521 aa  331  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  35.5 
 
 		 496 aa  330  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.18 
 
 		 517 aa  330  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  40.89 
 
 		 503 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.49 
 
 		 518 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  40.63 
 
 		 524 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  39.29 
 
 		 494 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  41.37 
 
 		 508 aa  328  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  39.58 
 
 		 524 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 510 aa  326  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  39.47 
 
 		 500 aa  326  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  41.08 
 
 		 507 aa  326  6e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  37.53 
 
 		 494 aa  326  6e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  38.78 
 
 		 518 aa  326  6e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  40.34 
 
 		 524 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  43.24 
 
 		 517 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  41.41 
 
 		 514 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0542  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.32 
 
 		 511 aa  325  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  38.13 
 
 		 499 aa  324  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  36.75 
 
 		 501 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  42.77 
 
 		 517 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0843  ABC transporter related  43.26 
 
 		 496 aa  323  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.0750454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  39.38 
 
 		 524 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 497 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  38.37 
 
 		 494 aa  323  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  39.38 
 
 		 524 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  34.89 
 
 		 500 aa  323  4e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  37.02 
 
 		 498 aa  322  7e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  40.84 
 
 		 518 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 		 517 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.75 
 
 		 527 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  35.74 
 
 		 499 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  38.41 
 
 		 510 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 		 517 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 		 517 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 		 507 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  39.63 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  39.26 
 
 		 503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  40.62 
 
 		 507 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  40.17 
 
 		 508 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 		 492 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4769  ABC transporter related  41.7 
 
 		 494 aa  320  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.12 
 
 		 517 aa  320  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  40.88 
 
 		 499 aa  320  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  37.78 
 
 		 501 aa  320  5e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  40.62 
 
 		 507 aa  319  6e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  43.42 
 
 		 517 aa  319  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.08 
 
 		 506 aa  319  7e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  37.55 
 
 		 513 aa  319  9e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  42.63 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  37.58 
 
 		 501 aa  317  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  40.6 
 
 		 522 aa  317  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.56 
 
 		 512 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  40.76 
 
 		 513 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  37.58 
 
 		 501 aa  317  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  37.58 
 
 		 501 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  39.6 
 
 		 506 aa  317  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>