12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3117 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3117  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  248  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100633  normal  0.0374199 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3472  hypothetical protein  96.97 
 
 		 132 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0170  hypothetical protein  46 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01170  hypothetical protein  45 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4079  hypothetical protein  46.91 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241871 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2333  hypothetical protein  45.54 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00580597  hitchhiker  0.00510153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0537  hypothetical protein  45.78 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2434  hypothetical protein  42.06 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137351  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3179  hypothetical protein  51.56 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  27.97 
 
 		 709 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2825  hypothetical protein  31.19 
 
 		 141 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  46.34 
 
 		 731 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>