277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2351 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5230  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  68.58 
 
 
550 aa  675    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0375516  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0379  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  68.04 
 
 
541 aa  740    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0363  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  68.6 
 
 
541 aa  746    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4962  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  73.39 
 
 
540 aa  750    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3659  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  64.72 
 
 
557 aa  666    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.323256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2792  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  69.21 
 
 
539 aa  673    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.36314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0696  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 
535 aa  1080    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375098  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2351  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 
535 aa  1080    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.244675  normal  0.258232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0459  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  68.09 
 
 
555 aa  680    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306699  normal  0.0526078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0534  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  96.82 
 
 
535 aa  1050    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3332  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  69.43 
 
 
496 aa  674    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260717  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0017  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  67.82 
 
 
548 aa  666    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2578  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  74.52 
 
 
548 aa  722    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3857  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  78.32 
 
 
532 aa  862    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0661  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  84.14 
 
 
533 aa  894    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2437  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  69.28 
 
 
547 aa  701    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.645998  normal  0.705393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0015  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.62 
 
 
550 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2111  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  68.58 
 
 
550 aa  675    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3464  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0730  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  67.82 
 
 
548 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.371164  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0020  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  68.45 
 
 
548 aa  669    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2545  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  80.97 
 
 
534 aa  885    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.199988  normal  0.933965 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1676  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  68.54 
 
 
552 aa  712    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738116  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2092  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  73.99 
 
 
549 aa  748    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196444  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5015  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  73.55 
 
 
540 aa  702    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0469  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  71.18 
 
 
541 aa  751    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222667  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5935  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  69.94 
 
 
539 aa  747    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.137652 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1149  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  69.46 
 
 
550 aa  670    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6268  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  69.94 
 
 
539 aa  747    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1532  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  71.96 
 
 
563 aa  741    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.94152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3270  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  65.23 
 
 
552 aa  685    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216539  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1848  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  82.26 
 
 
539 aa  883    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2353  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  64.63 
 
 
472 aa  619  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000365597  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0629  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.37 
 
 
485 aa  608  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101776  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0713  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.15 
 
 
475 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000329894  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02303  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.29 
 
 
477 aa  604  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0338  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.9 
 
 
484 aa  598  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0297011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1827  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.14 
 
 
474 aa  599  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003467  cytochrome c oxidase subunit CcoN  62.45 
 
 
475 aa  598  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1277  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.32 
 
 
476 aa  600  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552433  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3782  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.61 
 
 
478 aa  601  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0141509  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2041  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62 
 
 
482 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20010  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.81 
 
 
480 aa  595  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1563  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.24 
 
 
476 aa  596  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3773  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.55 
 
 
475 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44340  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.55 
 
 
475 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0939  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  61.46 
 
 
482 aa  595  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4250  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.4 
 
 
474 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3816  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.62 
 
 
474 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1618  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.4 
 
 
474 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.772604  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2044  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.9 
 
 
482 aa  593  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0265889  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3569  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.55 
 
 
474 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4487  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.07 
 
 
478 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3777  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.19 
 
 
475 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2214  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.07 
 
 
478 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000199184  normal  0.656675 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1053  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.12 
 
 
477 aa  589  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0569715  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1959  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.63 
 
 
478 aa  589  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0873293  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2170  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.07 
 
 
478 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00937158  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1523  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.1 
 
 
479 aa  591  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.279283  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2220  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.07 
 
 
478 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00351736  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2201  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.07 
 
 
478 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00427716  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1882  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.72 
 
 
474 aa  588  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.746133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44370  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.19 
 
 
475 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2214  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.96 
 
 
478 aa  587  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000208976  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1995  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  63.16 
 
 
474 aa  587  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.833948  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2779  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.41 
 
 
479 aa  587  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000451969 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2364  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.57 
 
 
478 aa  585  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2425  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.54 
 
 
474 aa  585  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408104  hitchhiker  0.0000966631 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1851  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.29 
 
 
477 aa  586  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000190326  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1985  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.96 
 
 
475 aa  588  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279534  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2604  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.97 
 
 
480 aa  585  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000152837  normal  0.741537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2006  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.57 
 
 
478 aa  585  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00103508  hitchhiker  0.0000000337866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1969  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.57 
 
 
478 aa  585  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00116918  normal  0.0108998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2107  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.57 
 
 
478 aa  585  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000291531  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0643  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  59.66 
 
 
473 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000439174  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2211  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.54 
 
 
475 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2599  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  61.7 
 
 
479 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00049011  normal  0.717457 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2010  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.77 
 
 
475 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000523358  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1791  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.02 
 
 
478 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398025  normal  0.231358 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3000  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.55 
 
 
496 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0591739  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4255  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.15 
 
 
480 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0453  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.7 
 
 
480 aa  580  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.922197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1613  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.15 
 
 
480 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00989974  hitchhiker  0.00775448 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1197  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.96 
 
 
485 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1104  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.96 
 
 
485 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0460465  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0631  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.2 
 
 
472 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3820  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.93 
 
 
480 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1784  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.59 
 
 
476 aa  581  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1363  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.98 
 
 
491 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.41805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0958  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.97 
 
 
475 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0979649  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3573  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.72 
 
 
480 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02054  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.55 
 
 
477 aa  576  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.02911  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1930  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.68 
 
 
478 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000131874  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2422  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.59 
 
 
490 aa  577  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.505766  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10500  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.97 
 
 
475 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3413  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  60.68 
 
 
480 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0737361 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1823  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.96 
 
 
480 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2250  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  56.35 
 
 
547 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1170  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.72 
 
 
486 aa  572  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3436  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  59.96 
 
 
480 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0784  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  59.24 
 
 
493 aa  570  1e-161  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>