More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2130 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2403  lysine--tRNA ligase  91.96 
 
 		 380 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.550576 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0478  putative lysyl-tRNA synthetase  98.55 
 
 		 345 aa  680    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181681  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2130  lysine--tRNA ligase  100 
 
 		 375 aa  748    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6025  lysyl-tRNA synthetase  72.17 
 
 		 357 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.858577  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1654  lysine--tRNA ligase  75.29 
 
 		 348 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.693299 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4127  Lysine--tRNA ligase  69.01 
 
 		 353 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.271818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3798  Lysine--tRNA ligase  68.71 
 
 		 353 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00227981  normal  0.497071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0378  lysine--tRNA ligase  71.35 
 
 		 350 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.682721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3193  tRNA synthetase class II (D K and N)  70.09 
 
 		 352 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3004  tRNA synthetase class II (D K and N)  69.59 
 
 		 352 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0405088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3229  tRNA synthetase class II (D K and N)  69.21 
 
 		 352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3477  lysine--tRNA ligase  69.79 
 
 		 350 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1885  tRNA synthetase class II (D K and N)  69.77 
 
 		 350 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70209  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0762  lysine--tRNA ligase  68.42 
 
 		 349 aa  448  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756358  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2739  lysine--tRNA ligase  69.01 
 
 		 351 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0454  Lysine--tRNA ligase  61.76 
 
 		 351 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.444787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4013  putative lysyl-tRNA synthetase (lysine--tRNA ligase)  60.29 
 
 		 351 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2530  lysine--tRNA ligase  60.61 
 
 		 363 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.83  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1642  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  59.48 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.576369  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2505  lysine--tRNA ligase  60.7 
 
 		 351 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.418111  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2793  tRNA synthetase class II (D K and N)  61.47 
 
 		 351 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2808  lysine--tRNA ligase  59.71 
 
 		 350 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2301  lysine--tRNA ligase  60.29 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275563  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2955  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  59.94 
 
 		 351 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3224  lysine--tRNA ligase  58.24 
 
 		 361 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.428603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1078  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  54.89 
 
 		 358 aa  323  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2375  lysine--tRNA ligase  47.92 
 
 		 329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1498  tRNA synthetase class II (D K and N)  44.92 
 
 		 340 aa  246  6e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205908  normal  0.591538 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3783  tRNA synthetase class II (D K and N)  45.23 
 
 		 339 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3867  tRNA synthetase class II (D K and N)  45.54 
 
 		 339 aa  225  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1839  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  42.51 
 
 		 307 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000593972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3726  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  44.98 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3854  tRNA synthetase class II (D K and N)  45.77 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2148  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  39.76 
 
 		 307 aa  216  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000938384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2490  hypothetical protein  41.82 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2162  tRNA synthetase class II (D K and N)  39.94 
 
 		 305 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0344  lysyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000187091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2054  tRNA synthetase class II (D K and N)  40.55 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4741  lysyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 325 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4614  lysyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 325 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.594866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4705  lysyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 325 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4622  lysyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 325 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0472  lysyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4762  lysyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 325 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.827317 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0383  lysyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3277  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  36.17 
 
 		 326 aa  195  9e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4687  lysyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.981409  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04027  lysyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3835  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  36.63 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4714  lysyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03989  hypothetical protein  36.63 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4399  lysyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5673  lysyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.17046 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0076  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  38.79 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211286 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1764  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  40.56 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.076019  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4626  lysyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0839984 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3757  lysyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3855  lysyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 325 aa  193  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133285 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002238  lysyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 323 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1753  lysyl-tRNA synthetase-related protein  40.06 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0420  lysyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 325 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643447 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0685  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  43.09 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.572683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3935  lysyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 325 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00130  lysyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 323 aa  190  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03677  lysyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547578  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2229  lysyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 		 349 aa  186  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.188508  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0712  lysyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 325 aa  187  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.292044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3665  lysyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 325 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3812  lysyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 325 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1276  lysyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 323 aa  186  7e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2625  lysyl-tRNA synthetase-related protein  36.99 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 498 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  35.31 
 
 		 498 aa  182  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0442  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  35.07 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0578  lysyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 		 498 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.873191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2787  lysyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 		 328 aa  179  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.638173  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 		 495 aa  177  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2781  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  38.44 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1914  tRNA synthetase class II (D K and N)  42.54 
 
 		 302 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000371414  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 		 489 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0046  hypothetical protein  31.73 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4763  hypothetical protein  34.26 
 
 		 325 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0588  lysyl-tRNA synthetase-like GenX  36.62 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.00871089  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 484 aa  170  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 		 495 aa  169  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1319  hypothetical protein  36.62 
 
 		 329 aa  169  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2207  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  35.74 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 		 491 aa  169  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  31.52 
 
 		 494 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1456  lysyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 510 aa  168  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.370095  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1681  lysyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 491 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  31.64 
 
 		 515 aa  168  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  31.64 
 
 		 515 aa  168  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  31.21 
 
 		 494 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2016  lysyl-tRNA synthetase homolog GenX  31.58 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 		 499 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0983  lysyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 496 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1740  lysine--tRNA ligase  34.81 
 
 		 324 aa  166  8e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 489 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1233  tRNA synthetase class II (D K and N)  37.5 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.685644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>