More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0349 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1703  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 150 aa  299  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.978743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0335  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 150 aa  299  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.108088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0349  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 150 aa  299  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  0.954559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2546  50S ribosomal protein L11  96.67 
 
 		 150 aa  291  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0743  50S ribosomal protein L11  77.33 
 
 		 150 aa  243  6.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0168765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0563  50S ribosomal protein L11  72.67 
 
 		 150 aa  232  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0229  50S ribosomal protein L11  69.8 
 
 		 141 aa  216  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0737159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0260  50S ribosomal protein L11  65.77 
 
 		 141 aa  207  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1823  50S ribosomal protein L11  63.33 
 
 		 142 aa  193  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1248  50S ribosomal protein L11  62 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208102  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1943  50S ribosomal protein L11  61.33 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0464106  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1209  50S ribosomal protein L11  61.33 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3472  50S ribosomal protein L11  60.67 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3360  50S ribosomal protein L11  62.25 
 
 		 149 aa  180  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711541  normal  0.0993173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1895  50S ribosomal protein L11  63.58 
 
 		 149 aa  179  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00848778  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0974  50S ribosomal protein L11  58.67 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0169903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3201  50S ribosomal protein L11  58.67 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2277  50S ribosomal protein L11  58.67 
 
 		 142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4435  50S ribosomal protein L11  59.46 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2699  50S ribosomal protein L11  59.46 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1320  50S ribosomal protein L11  60.26 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.458077  normal  0.354215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3692  50S ribosomal protein L11  58.67 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2725  50S ribosomal protein L11  60.81 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.053271  normal  0.344751 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0567  50S ribosomal protein L11  60 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000313352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5087  50S ribosomal protein L11  58.67 
 
 		 142 aa  176  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0150529  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1418  50S ribosomal protein L11  60.26 
 
 		 143 aa  176  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.816838  normal  0.409457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0366  50S ribosomal protein L11  60.93 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.556831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3864  50S ribosomal protein L11  59.33 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.094811 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1346  50S ribosomal protein L11  58.11 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1819  50S ribosomal protein L11  58.94 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.674274  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4479  50S ribosomal protein L11  61.07 
 
 		 149 aa  174  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.116723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1527  50S ribosomal protein L11  58.78 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3998  50S ribosomal protein L11  61.07 
 
 		 149 aa  174  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.748509  normal  0.915544 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1806  50S ribosomal protein L11  58.78 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.785581  normal  0.199785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4367  50S ribosomal protein L11  61.07 
 
 		 149 aa  174  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3844  50S ribosomal protein L11  61.07 
 
 		 149 aa  173  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0836  50S ribosomal protein L11P  61.07 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00174211  normal  0.0898369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2563  50S ribosomal protein L11  58.11 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06120  50S ribosomal protein L11  57.33 
 
 		 143 aa  170  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2956  50S ribosomal protein L11  57.72 
 
 		 144 aa  170  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0664749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3656  50S ribosomal protein L11  58.67 
 
 		 143 aa  169  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00490061  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  58 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0302  50S ribosomal protein L11  55.33 
 
 		 145 aa  169  9e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000139433  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0486  50S ribosomal protein L11  57.33 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0527955  hitchhiker  0.00000142246 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  58 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  58.11 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  58 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1442  50S ribosomal protein L11  59.46 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0315  50S ribosomal protein L11  57.33 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116049  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3920  50S ribosomal protein L11  58 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  57.33 
 
 		 143 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  58.67 
 
 		 143 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  58.11 
 
 		 141 aa  167  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  57.33 
 
 		 143 aa  167  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0615  ribosomal protein L11  58 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.956774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4559  50S ribosomal protein L11  58 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275981  normal  0.0500923 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  57.33 
 
 		 143 aa  167  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  58 
 
 		 143 aa  167  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  57.33 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  57.33 
 
 		 143 aa  167  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  57.33 
 
 		 143 aa  167  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0042  50S ribosomal protein L11  57.33 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000150349  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  58 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0920  50S ribosomal protein L11  54.67 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000795353  hitchhiker  0.00000174139 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  58.78 
 
 		 141 aa  167  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4287  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 144 aa  166  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000848232  hitchhiker  0.000000453889 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  52.67 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0826  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222387  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  58.78 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0833  50S ribosomal protein L11  54.73 
 
 		 143 aa  165  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.714386  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2971  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.621539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3318  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08720  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444282  hitchhiker  0.00204472 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  57.33 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3038  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0450649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3193  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.177211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  57.33 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1956  50S ribosomal protein L11  54.36 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0312  ribosomal protein L11  56 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000294677  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3338  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  54.05 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  56.08 
 
 		 141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0443  50S ribosomal protein L11  57.33 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273232  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4760  50S ribosomal protein L11  57.33 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000974914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0745  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00286512  normal  0.949117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0476  50S ribosomal protein L11  57.33 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000067383  normal  0.0123717 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2040  50S ribosomal protein L11  56 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000854354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0473  50S ribosomal protein L11  57.33 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.015667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5090  50S ribosomal protein L11  56.67 
 
 		 143 aa  164  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000105007  normal  0.538153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>