173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3703 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3703  hypothetical protein  100 
 
 		 48 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.730756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0861  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 190 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 190 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 190 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 190 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 190 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 190 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 190 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 190 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 336 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0168  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 201 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3532  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00922044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3540  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.718907 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0173  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0829  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2133  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3823  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4288  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  93.33 
 
 		 186 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  93.33 
 
 		 186 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  93.33 
 
 		 186 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4093  transposase IS4 family protein  93.33 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550334  normal  0.402512 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1006  transposase, IS4 family protein  93.33 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5037  IS4 family transposase  95.56 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505561  normal  0.915342 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5032  IS4 family transposase  95.56 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137379  normal  0.729645 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4638  transposase IS4 family protein  91.11 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4034  transposase IS4 family protein  91.11 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492844  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4650  transposase IS4 family protein  91.11 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3758  transposase IS4 family protein  91.11 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0586009  normal  0.260182 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0506  IS4 family transposase  91.11 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1528  IS4 family transposase  91.11 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2758  IS4 family transposase  91.11 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1839  transposase, IS4 family protein  90.24 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.181674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4122  hypothetical protein  90.24 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2296  transposase  95 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0174  IS4 family transposase  87.18 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0807  transposase  64.44 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1594  transposase  64.44 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2135  transposase  64.44 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3262  transposase  64.44 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  64.44 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  62.22 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4160  response regulator receiver protein  82.05 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0419  transposase IS4  64.44 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0597  transposase IS4  64.44 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0838  transposase IS4  64.44 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1298  transposase IS4  64.44 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.618797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1525  transposase IS4  64.44 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1643  transposase IS4  64.44 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1645  transposase IS4  64.44 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1687  transposase IS4  64.44 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2027  transposase IS4  64.44 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2347  transposase IS4  64.44 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00020548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2458  transposase IS4  64.44 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2606  transposase IS4  64.44 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1319  transposase IS4  64.44 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0317  hypothetical protein  73.17 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0535  IS5 family transposase orfB  65.85 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0531  IS5 family transposase orfB  65.85 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00392831  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  66.67 
 
 		 251 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  66.67 
 
 		 251 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  66.67 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  62.22 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  58.7 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  56.82 
 
 		 252 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  56.82 
 
 		 252 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  56.82 
 
 		 167 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  56.82 
 
 		 252 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  56.82 
 
 		 252 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7817  transposase  55.56 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  53.19 
 
 		 266 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_004310  BR0514  transposase, interruption-C  51.06 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.414231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  57.5 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  57.5 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  57.78 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  57.5 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  57.5 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  57.5 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  57.78 
 
 		 260 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  45.45 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  48.94 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  55.56 
 
 		 260 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  55.56 
 
 		 260 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  55.56 
 
 		 260 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  55.56 
 
 		 260 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  45.45 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  44.44 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  45.45 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  57.78 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  46.81 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  46.81 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  46.81 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  46.81 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>