More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3618 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3618  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  460  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  62.84 
 
 		 234 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2150  glycosyl transferase  60.54 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 		 206 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  37.86 
 
 		 222 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  36.54 
 
 		 209 aa  118  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  35.92 
 
 		 693 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6919  glycosyl transferase family 2  38.24 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000675814  hitchhiker  0.000119796 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 		 222 aa  91.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  36.53 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1787  family 2 glycosyl transferase  39.05 
 
 		 210 aa  89  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.350467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  41.61 
 
 		 1099 aa  85.9  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1959  glycosyl transferase family 2  36.53 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.597827  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  36.94 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  43.51 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0136  dolichyl-phosphate mannose synthase  45.61 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0298  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00219104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  36.42 
 
 		 461 aa  78.6  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.61 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  43.64 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  40.35 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1685  glycosyl transferase family 2  37.27 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.908588  hitchhiker  0.00379696 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1612  glycosyl transferase family protein  52.73 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  39.2 
 
 		 448 aa  75.1  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.38 
 
 		 334 aa  75.5  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  50 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  45.78 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  41.94 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  47.62 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  48.84 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  35.34 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  42.53 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  36.67 
 
 		 330 aa  72  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.38 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  43.12 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3003  b-glycosyltransferase  28.34 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00616181  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  29.63 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.07 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  40 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  45.83 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  43.31 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  30.89 
 
 		 478 aa  69.7  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.9 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06620  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  37.59 
 
 		 355 aa  68.9  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  40.24 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  40.74 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  38.38 
 
 		 694 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  35.9 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  40.74 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  43.82 
 
 		 344 aa  67  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0260  glycosyl transferase family 2  42.37 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.306809  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  33.78 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  44.9 
 
 		 314 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  37.39 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  38.26 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  38.26 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0771  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 		 339 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0726  putative glycosyltransferase protein  40.45 
 
 		 349 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  38.26 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0083  glycosyltransferase  38.61 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.413849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  47.06 
 
 		 544 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01630  glycosyl transferase  43.22 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.76765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  39.25 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  32.85 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  42.52 
 
 		 380 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  44.68 
 
 		 428 aa  65.5  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  39.08 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 		 327 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  44.83 
 
 		 331 aa  65.1  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  36.61 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  42.17 
 
 		 528 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  40.45 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  42.05 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  37.4 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  45.45 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  49.44 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  33.57 
 
 		 752 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  38.05 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3189  glycosyl transferase family 2  41.53 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0208978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>