More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3307 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3307  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19611  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1585  LysR family transcriptional regulator  62.02 
 
 
306 aa  356  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173107  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2792  LysR family transcriptional regulator  62.02 
 
 
307 aa  353  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3802  LysR family transcriptional regulator  58.76 
 
 
309 aa  330  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.238076  normal  0.337014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6388  LysR family transcriptional regulator  60.6 
 
 
304 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4681  transcriptional regulator, LysR family  59.01 
 
 
304 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.468795  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4725  transcriptional regulator, LysR family  58.3 
 
 
304 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255479  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0434  transcriptional regulator, LysR family  47.02 
 
 
312 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351851  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0029  regulatory protein, LysR  45.94 
 
 
304 aa  239  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.242113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0036  LysR family transcriptional regulator  45.23 
 
 
301 aa  236  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0224  LysR family transcriptional regulator  44.91 
 
 
312 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0362  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 
300 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2322  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 
298 aa  221  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5771  transcriptional regulator LysR family  41.52 
 
 
307 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2425  LysR family transcriptional regulator  47.1 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.540189  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4366  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.46 
 
 
305 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4456  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.46 
 
 
305 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000210908 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4530  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.46 
 
 
305 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  hitchhiker  0.00000332798 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4453  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.46 
 
 
305 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  hitchhiker  0.0000741656 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4025  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  42.91 
 
 
305 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4335  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.46 
 
 
305 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0017  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
304 aa  209  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.163482 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0724  LysR family transcriptional regulator  42.2 
 
 
327 aa  208  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0382  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
317 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4775  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  40.92 
 
 
305 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760624  hitchhiker  0.00336049 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03846  DNA-binding transcriptional dual regulator  43.11 
 
 
305 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4025  transcriptional regulator, LysR family  43.11 
 
 
305 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4195  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.11 
 
 
305 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03795  hypothetical protein  43.11 
 
 
305 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4503  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.11 
 
 
305 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.030834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4055  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.11 
 
 
305 aa  206  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4448  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.11 
 
 
305 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5423  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.11 
 
 
305 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.748146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4409  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.11 
 
 
305 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386018  normal  0.0576457 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0187  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  42.05 
 
 
302 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0127  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  42.05 
 
 
305 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.985261  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0193  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  42.05 
 
 
302 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3788  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  41.7 
 
 
302 aa  203  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3053  LysR family transcriptional regulator  40.29 
 
 
309 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2864  LysR family transcriptional regulator  43.19 
 
 
313 aa  202  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2323  oxidative stress transcriptional regulator  41.16 
 
 
301 aa  202  7e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523521  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  41.07 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2291  LysR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11333  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1336  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
298 aa  200  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0531475  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  40.71 
 
 
296 aa  199  6e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0334  transcriptional regulator, LysR family  40.2 
 
 
323 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.937617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0323  transcriptional regulator, LysR family  40.2 
 
 
323 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.712215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4222  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79182  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1919  LysR family transcriptional regulator  45 
 
 
314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.156623  normal  0.456297 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0119  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  40.93 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.985596  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4079  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  40.93 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0687  transcriptional regulator, LysR family  41.22 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.366193 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0138  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  40.93 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0609  LysR family transcriptional regulator  43.51 
 
 
312 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.663107  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3588  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
299 aa  195  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04591  oxidative stress transcriptional regulator  41.41 
 
 
313 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0312  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
323 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0465  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
298 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0192263  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2390  oxidative stress regulatory protein OxyR  37.63 
 
 
319 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0307  oxidative stress regulatory protein OxyR  37.63 
 
 
319 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2576  oxidative stress regulatory protein OxyR  37.63 
 
 
319 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1168  oxidative stress regulatory protein OxyR  37.63 
 
 
319 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6567  hydrogen peroxide-inducible genes activator protein  41.94 
 
 
314 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.222143  hitchhiker  0.00672743 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2661  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
319 aa  191  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.230449 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03200  transcriptional regulator  39.49 
 
 
300 aa  191  9e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1281  oxidative stress regulatory protein OxyR  37.28 
 
 
319 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3497  transcriptional regulator, substrate-binding, LysR family protein  39.43 
 
 
301 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.794623  hitchhiker  0.0000380526 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0693  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
319 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0589363  normal  0.107501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0241  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
319 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0594299  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0725  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
319 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3813  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
319 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0615  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
319 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0640  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
319 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3367  oxidative stress regulatory protein  37.28 
 
 
319 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3358  oxidative stress regulatory protein OxyR  37.28 
 
 
319 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3324  oxidative stress regulatory protein OxyR  37.28 
 
 
319 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519513  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4242  transcriptional regulator, LysR family  44.4 
 
 
309 aa  189  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
301 aa  189  7e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4881  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
317 aa  188  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635282  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2941  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
318 aa  188  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0354  transcriptional regulator OxyR  39.71 
 
 
317 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.241733  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0520  hydrogen peroxide-inducible genes activator  39.34 
 
 
311 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.454545  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  39.34 
 
 
311 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0711  transcriptional regulator, LysR family  36.59 
 
 
319 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0321  transcriptional regulator OxyR  39.71 
 
 
325 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1615  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
311 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2805  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
316 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0871  oxidative stress transcriptional regulator  40 
 
 
311 aa  186  4e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000180312  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0783  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
311 aa  186  5e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33611  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2690  hydrogen peroxide-inducible genes activator transcription regulator protein  35.79 
 
 
317 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00035  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.1 
 
 
302 aa  185  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3987  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2340  transcriptional regulator, LysR family  39.45 
 
 
313 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0164  LysR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.474897  normal  0.112541 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2714  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.31 
 
 
302 aa  182  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2522  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 
319 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0196222  normal  0.718346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5309  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 
308 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5218  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 
308 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2953  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 
315 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152689  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0202  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.52 
 
 
307 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>