50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2583 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2583  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  254  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000348076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  94.74 
 
 		 422 aa  196  9e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  34.62 
 
 		 409 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  32.35 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  33.33 
 
 		 419 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  35.87 
 
 		 436 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  38.37 
 
 		 544 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  33.68 
 
 		 407 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  31.58 
 
 		 416 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  31.25 
 
 		 417 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  31.82 
 
 		 413 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  31.82 
 
 		 413 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  29 
 
 		 390 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  33.65 
 
 		 398 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  36.9 
 
 		 435 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  33.72 
 
 		 408 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  32.14 
 
 		 413 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  33.33 
 
 		 413 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  39.68 
 
 		 409 aa  50.4  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  30.68 
 
 		 413 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  34.83 
 
 		 404 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  31.25 
 
 		 408 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  28.57 
 
 		 408 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  38.27 
 
 		 447 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4384  phage portal protein, HK97 family  31.82 
 
 		 264 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  37.5 
 
 		 433 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  30.11 
 
 		 423 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1060  HK97 family phage portal protein  29.29 
 
 		 412 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1080  HK97 family phage portal protein  29.29 
 
 		 412 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  37.97 
 
 		 455 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  28.87 
 
 		 424 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  30.95 
 
 		 417 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  35.21 
 
 		 389 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  27.27 
 
 		 473 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  30.95 
 
 		 426 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  35.21 
 
 		 404 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  34.48 
 
 		 401 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  30.34 
 
 		 436 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  30.34 
 
 		 436 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  29.25 
 
 		 392 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  24.47 
 
 		 389 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  32.32 
 
 		 399 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  32.32 
 
 		 392 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  27.84 
 
 		 395 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  33.33 
 
 		 859 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  33.33 
 
 		 833 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  33.33 
 
 		 833 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  29.55 
 
 		 464 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2959  phage portal protein, HK97 family  29.07 
 
 		 415 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  29 
 
 		 408 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>