More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1630 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1677  putative CheA signal transduction histidine kinases  70.19 
 
 
1095 aa  1325    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0952257  hitchhiker  0.00934326 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0042  chemotaxis histidine protein kinase, CheA3  71.35 
 
 
1095 aa  1344    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1630  putative CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1059 aa  2071    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571724  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1637  putative CheA signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  21.67 
 
 
699 aa  83.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  22.56 
 
 
713 aa  79  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  23.6 
 
 
871 aa  78.2  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0049  chemotaxis histidine protein kinase, CheA4  32.67 
 
 
399 aa  77.4  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1684  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.67 
 
 
399 aa  77.4  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300413  hitchhiker  0.0019378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  22.19 
 
 
657 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  24.43 
 
 
719 aa  76.3  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  21.88 
 
 
729 aa  75.9  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2487  CheA signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 
725 aa  75.1  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430185  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
796 aa  75.1  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  25.3 
 
 
691 aa  74.7  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 
732 aa  74.7  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2583  CheA signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 
711 aa  74.7  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1370  CheA signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 
687 aa  73.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0938961  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  23.68 
 
 
1031 aa  73.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  22.88 
 
 
770 aa  73.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  22.64 
 
 
660 aa  73.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  24.92 
 
 
681 aa  72.8  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 
664 aa  72.4  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 
725 aa  72.8  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  38.83 
 
 
766 aa  72.4  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  20.34 
 
 
715 aa  71.2  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  21.31 
 
 
658 aa  70.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  26.23 
 
 
669 aa  70.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 
919 aa  70.1  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  28.78 
 
 
748 aa  70.1  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  24.65 
 
 
720 aa  70.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  23.31 
 
 
766 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  21.86 
 
 
694 aa  69.3  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3196  CheA signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 
542 aa  68.9  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  23.15 
 
 
674 aa  68.6  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 
701 aa  68.6  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  23.76 
 
 
864 aa  68.2  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
954 aa  68.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  23.76 
 
 
864 aa  68.2  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 
681 aa  68.2  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  23.15 
 
 
662 aa  68.6  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  23.76 
 
 
864 aa  68.2  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  23.76 
 
 
864 aa  68.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  23.76 
 
 
864 aa  68.2  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  23.76 
 
 
864 aa  68.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  23.3 
 
 
919 aa  68.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  30.67 
 
 
625 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
830 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3064  CheA signal transduction histidine kinase  24.54 
 
 
710 aa  67.8  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  23.46 
 
 
685 aa  67.8  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  24.57 
 
 
764 aa  67.4  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  22.84 
 
 
669 aa  67.8  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  30 
 
 
639 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  23.3 
 
 
920 aa  67.4  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
911 aa  67.4  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  24.31 
 
 
709 aa  67.8  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  23.84 
 
 
610 aa  67  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  23.46 
 
 
672 aa  67  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  21.65 
 
 
887 aa  66.6  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  23.77 
 
 
655 aa  67  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  22.29 
 
 
758 aa  66.6  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  22.29 
 
 
763 aa  66.6  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  25 
 
 
760 aa  67  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  24.62 
 
 
878 aa  66.6  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  22.84 
 
 
669 aa  66.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  23.19 
 
 
832 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  23.15 
 
 
766 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2285  CheA signal transduction histidine kinases  34.29 
 
 
584 aa  66.2  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
934 aa  66.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  22.84 
 
 
669 aa  66.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3790  CheA signal transduction histidine kinases  25.15 
 
 
710 aa  66.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  22.84 
 
 
654 aa  65.9  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  21.31 
 
 
695 aa  65.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  22.13 
 
 
806 aa  65.5  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  22.7 
 
 
726 aa  65.5  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  23.88 
 
 
598 aa  65.1  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  20.8 
 
 
745 aa  65.1  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
911 aa  65.5  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  23.43 
 
 
747 aa  65.1  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  23.65 
 
 
715 aa  65.1  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  22.16 
 
 
692 aa  65.1  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  30.46 
 
 
1079 aa  65.1  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  23.15 
 
 
654 aa  64.7  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  22.53 
 
 
669 aa  64.7  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
756 aa  64.7  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  23.15 
 
 
654 aa  64.7  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  20.36 
 
 
671 aa  64.7  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  23.15 
 
 
654 aa  64.7  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  22.53 
 
 
669 aa  64.7  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  23.15 
 
 
654 aa  64.7  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  23.15 
 
 
652 aa  64.7  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  23.15 
 
 
654 aa  64.7  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  23.15 
 
 
724 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
756 aa  63.9  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  22.7 
 
 
772 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  22.94 
 
 
654 aa  64.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  24.7 
 
 
928 aa  64.3  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  22.53 
 
 
669 aa  64.3  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  23.15 
 
 
724 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  23.15 
 
 
652 aa  64.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>