100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1201 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1898  extracellular solute-binding protein  69.1 
 
 		 579 aa  783    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.477877  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6724  extracellular solute-binding protein family 1  61.83 
 
 		 580 aa  705    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4387  ABC sugar (glycerol) transporter, periplasmic binding protein  85.36 
 
 		 573 aa  1022    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1969  extracellular solute-binding protein  69.86 
 
 		 588 aa  773    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1738  extracellular solute-binding protein  67.78 
 
 		 579 aa  789    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.217891 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3169  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  66.9 
 
 		 573 aa  766    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000122164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0609  extracellular solute-binding protein  63.54 
 
 		 577 aa  739    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0389  extracellular solute-binding protein  65.52 
 
 		 577 aa  739    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.83487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2317  extracellular solute-binding protein  64.71 
 
 		 577 aa  738    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000660046  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1321  extracellular solute-binding protein  93.55 
 
 		 574 aa  1114    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00160153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5939  extracellular solute-binding protein family 1  65.47 
 
 		 610 aa  749    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1201  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 572 aa  1176    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.487559  normal  0.842714 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5372  extracellular solute-binding protein  61.65 
 
 		 580 aa  702    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.737373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2047  extracellular solute-binding protein  70.62 
 
 		 580 aa  790    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120072  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1030  extracellular solute-binding protein  64 
 
 		 577 aa  736    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2227  putative periplasmic binding ABC transporter protein, putative sugar binding precursor  70.45 
 
 		 580 aa  802    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272484  normal  0.0425945 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3127  sugar ABC transporter  65.18 
 
 		 579 aa  739    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1445  extracellular solute-binding protein family 1  69.91 
 
 		 579 aa  782    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0779886  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3473  extracellular solute-binding protein  69.1 
 
 		 579 aa  782    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.971584  hitchhiker  0.00076059 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3982  extracellular solute-binding protein  75.65 
 
 		 573 aa  914    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.227864  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5977  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  74.39 
 
 		 574 aa  904    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2986  putative signal peptide protein  63.7 
 
 		 581 aa  716    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0375  extracellular solute-binding protein  64.8 
 
 		 574 aa  758    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812044  normal  0.244045 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2909  extracellular solute-binding protein  76.83 
 
 		 574 aa  920    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0483  twin-arginine translocation pathway signal  64.76 
 
 		 579 aa  742    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00131469  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3051  putative signal peptide protein  64.13 
 
 		 580 aa  712    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0886733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3391  extracellular solute-binding protein  62.36 
 
 		 577 aa  713    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3735  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  64.48 
 
 		 590 aa  748    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1742  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  64.36 
 
 		 590 aa  744    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2204  extracellular solute-binding protein  64.79 
 
 		 579 aa  742    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3630  extracellular solute-binding protein  67.43 
 
 		 580 aa  793    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2663  ABC sugar (glycerol) transporter, periplasmic binding protein  93.55 
 
 		 574 aa  1112    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.716249  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0381  extracellular solute-binding protein  65.34 
 
 		 577 aa  737    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000205955  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4211  extracellular solute-binding protein  70.62 
 
 		 598 aa  798    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.64235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4098  extracellular solute-binding protein  75.66 
 
 		 569 aa  903    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00991271  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3671  extracellular solute-binding protein  62.33 
 
 		 577 aa  734    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00462233  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1367  extracellular solute-binding protein  69.42 
 
 		 595 aa  807    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3333  conserved hypothetical signal peptide protein  64.13 
 
 		 578 aa  718    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0100  hypothetical protein  70.61 
 
 		 574 aa  860    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0356789  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4063  extracellular solute-binding protein  70.26 
 
 		 599 aa  788    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.159076  normal  0.524387 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2089  extracellular solute-binding protein  59.44 
 
 		 593 aa  697    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115344  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2229  extracellular solute-binding protein  64.09 
 
 		 580 aa  739    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0301867  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9075  hypothetical protein  72.71 
 
 		 558 aa  851    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2416  extracellular solute-binding protein  65.12 
 
 		 577 aa  731    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000012875  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2264  extracellular solute-binding protein, family 1  69.1 
 
 		 579 aa  782    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.864304  decreased coverage  0.00109234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1597  extracellular solute-binding protein  79.3 
 
 		 573 aa  937    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6464  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  74.22 
 
 		 574 aa  902    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4889  putative periplasmic binding ABC transporter protein, putative sugar binding precursor  69.43 
 
 		 596 aa  813    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1918  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  57.94 
 
 		 573 aa  625  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000332483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2095  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  51.39 
 
 		 569 aa  581  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.105917 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3584  hypothetical protein  26.29 
 
 		 484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.638591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2051  extracellular solute-binding protein family 1  29.14 
 
 		 536 aa  101  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0287  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 477 aa  91.3  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0258  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 477 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  22.07 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 436 aa  67  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  45.9 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2901  extracellular solute-binding protein family 1  45.9 
 
 		 425 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.99 
 
 		 486 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.93 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  21.35 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  39.44 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1533  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 478 aa  54.7  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.219593 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 433 aa  54.7  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03340  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 		 439 aa  53.9  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5638  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 443 aa  53.9  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 		 439 aa  51.2  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6371  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 443 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.970426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 		 439 aa  50.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1283  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 497 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2090  extracellular solute-binding protein family 1  32.77 
 
 		 480 aa  50.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2375  transporter, putative  24.92 
 
 		 479 aa  49.3  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.229304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  37.14 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2670  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 482 aa  48.5  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00030492  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 498 aa  48.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1212  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 497 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1213  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 497 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 440 aa  47.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  34.86 
 
 		 439 aa  47.4  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  21.57 
 
 		 447 aa  47  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2488  extracellular solute-binding protein family 1  29.36 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.56273  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1047  extracellular solute-binding protein  22.17 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 449 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.11 
 
 		 439 aa  44.7  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2164  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 481 aa  44.3  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3164  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 467 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.625995  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1420  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 478 aa  43.9  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30312  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3021  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 487 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2594  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 475 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3006  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 467 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2600  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 475 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2555  twin-arginine translocation pathway signal  31.4 
 
 		 475 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  20.45 
 
 		 448 aa  43.5  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>