More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2774 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2774  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
729 aa  1421    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.784687  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  32.83 
 
 
712 aa  290  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.85 
 
 
711 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.38 
 
 
712 aa  264  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.41 
 
 
712 aa  263  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.2 
 
 
567 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.37 
 
 
561 aa  226  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.78 
 
 
567 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 
673 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.05 
 
 
565 aa  224  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430745  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  38.83 
 
 
688 aa  223  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  38.93 
 
 
566 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  39.47 
 
 
565 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  36.32 
 
 
577 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.98 
 
 
672 aa  219  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.48 
 
 
561 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 
566 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.03 
 
 
562 aa  216  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  37.86 
 
 
565 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  39.4 
 
 
688 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.83 
 
 
560 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.53 
 
 
586 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  34.11 
 
 
602 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  38.89 
 
 
566 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  39.57 
 
 
563 aa  210  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  40.74 
 
 
559 aa  210  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  39.9 
 
 
563 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.02 
 
 
688 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.5 
 
 
674 aa  210  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.98 
 
 
561 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.3 
 
 
568 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.21 
 
 
656 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.53 
 
 
689 aa  207  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4105  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 
561 aa  207  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  36.96 
 
 
714 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  39.04 
 
 
674 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 
675 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6589  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.79 
 
 
558 aa  205  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.61 
 
 
572 aa  205  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.34 
 
 
556 aa  204  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.395485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2072  chemotaxis sensory transducer  37.34 
 
 
556 aa  204  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68132  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.01 
 
 
670 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.67 
 
 
573 aa  204  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 
566 aa  204  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.61 
 
 
698 aa  204  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  38.25 
 
 
561 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.36 
 
 
560 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196109  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  39.59 
 
 
688 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  38.15 
 
 
698 aa  201  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  39.22 
 
 
552 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  35.73 
 
 
568 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  36.58 
 
 
542 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  39.44 
 
 
608 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2032  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.45 
 
 
558 aa  201  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.176129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 
561 aa  201  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.73 
 
 
560 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4788  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.97 
 
 
561 aa  200  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.36 
 
 
563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2363  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.86 
 
 
695 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0713  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.38 
 
 
685 aa  199  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.862704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.57 
 
 
575 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.26 
 
 
688 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  30.56 
 
 
656 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 
561 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.47 
 
 
559 aa  198  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.50218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.42 
 
 
563 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  39.83 
 
 
736 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.63 
 
 
741 aa  197  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.6 
 
 
561 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2708  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.19 
 
 
696 aa  197  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.674681  normal  0.192785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.6 
 
 
655 aa  197  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.92 
 
 
562 aa  196  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.9 
 
 
567 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  35.53 
 
 
656 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.81 
 
 
681 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.32 
 
 
561 aa  196  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  37.26 
 
 
676 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.05 
 
 
698 aa  195  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.62 
 
 
563 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.27 
 
 
587 aa  196  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.76 
 
 
641 aa  196  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640734  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.53 
 
 
694 aa  196  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.4 
 
 
557 aa  195  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3533  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.14 
 
 
560 aa  195  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.89 
 
 
681 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.08 
 
 
689 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  33.92 
 
 
716 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.84 
 
 
561 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.44 
 
 
558 aa  192  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0546434  normal  0.151916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.56 
 
 
550 aa  192  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.67 
 
 
563 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.99 
 
 
568 aa  191  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 
568 aa  191  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.52 
 
 
566 aa  191  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.12 
 
 
561 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  39.53 
 
 
707 aa  191  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.29 
 
 
730 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.38 
 
 
561 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.12 
 
 
656 aa  190  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.72 
 
 
655 aa  190  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>