213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2625 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2625  tRNA-processing RNAse BN  100 
 
 		 440 aa  848    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721412  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  36.51 
 
 		 451 aa  213  7e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  37.21 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0452  ribonuclease BN, putative  34.95 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  38.87 
 
 		 295 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  36.65 
 
 		 336 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  40.08 
 
 		 337 aa  179  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  40.08 
 
 		 337 aa  179  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  41.26 
 
 		 447 aa  179  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  29.71 
 
 		 412 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  38.75 
 
 		 285 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  39.68 
 
 		 337 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  37.31 
 
 		 298 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  38.98 
 
 		 323 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  38.98 
 
 		 323 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  38.98 
 
 		 323 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  38.58 
 
 		 323 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  39.92 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  35.02 
 
 		 340 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  39.16 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  39.16 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  39.16 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  39.16 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  39.16 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  28.99 
 
 		 412 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  32.98 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  33.43 
 
 		 408 aa  170  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  38.49 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  38.49 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  38.49 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  38.49 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  38.49 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  38.49 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  38.49 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  38.49 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  38.49 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  37.09 
 
 		 296 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  37.88 
 
 		 437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  37.88 
 
 		 437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  37.88 
 
 		 437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  37.88 
 
 		 437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  37.88 
 
 		 437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  37.64 
 
 		 290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  37.8 
 
 		 294 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  37.5 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  41.27 
 
 		 294 aa  162  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  36.99 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  36.84 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  35.61 
 
 		 310 aa  162  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  32.96 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  37.88 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  37.88 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  38.13 
 
 		 294 aa  160  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  38.96 
 
 		 442 aa  160  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  35.23 
 
 		 303 aa  160  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  39.36 
 
 		 294 aa  160  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  35.71 
 
 		 436 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  39.36 
 
 		 294 aa  160  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  38.93 
 
 		 416 aa  159  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  35.82 
 
 		 439 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  29.41 
 
 		 411 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  38.61 
 
 		 313 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  36.68 
 
 		 417 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  37.74 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  37.26 
 
 		 442 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  38.06 
 
 		 300 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  37.74 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  36.48 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  37.26 
 
 		 442 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  40.33 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  37.26 
 
 		 442 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  38.28 
 
 		 314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  35.53 
 
 		 403 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00593  ribonuclease BN  38.82 
 
 		 314 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  37.7 
 
 		 297 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04555  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  31.44 
 
 		 425 aa  150  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  35.96 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  36.72 
 
 		 441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0716  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  31.13 
 
 		 424 aa  146  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603481  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2991  ribonuclease BN, putative  35.8 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  31.51 
 
 		 499 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  33.59 
 
 		 433 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  39.76 
 
 		 443 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  39.76 
 
 		 443 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  35.64 
 
 		 404 aa  142  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  28.18 
 
 		 538 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1830  ribonuclease BN, putative  39.34 
 
 		 404 aa  141  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0291213 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  27.69 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1623  ribonuclease BN  31.72 
 
 		 428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722239  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0935  ribonuclease BN  37.35 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  32.65 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  34.16 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  29.96 
 
 		 292 aa  134  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  33.81 
 
 		 429 aa  133  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  27.82 
 
 		 525 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1013  ribonuclease BN  28.72 
 
 		 427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.58276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1895  ribonuclease BN, putative  34.07 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0979  putative ribonuclease BN  33.6 
 
 		 282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1323  ribonuclease BN  36.39 
 
 		 427 aa  131  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  32.38 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>