19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2487 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2487  BsuBIPstI restriction endonuclease-like  100 
 
 		 416 aa  823    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0366551  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0793  BsuBIPstI restriction endonuclease domain-containing protein  54.37 
 
 		 359 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0992  BsuBIPstI restriction endonuclease domain-containing protein  47.16 
 
 		 365 aa  336  5e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00476736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2533  Type II site-specific deoxyribonuclease  24.91 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0105  Type II site-specific deoxyribonuclease  27.24 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0761637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4526  Type II site-specific deoxyribonuclease  26.11 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3089  Type II site-specific deoxyribonuclease  26.09 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2785  BsuBI/PstI restriction endonuclease, C-terminal  24.9 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2495  Type II site-specific deoxyribonuclease  23.05 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0786998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  46.55 
 
 		 3409 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2176  restriction endonuclease  46.34 
 
 		 669 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4248  hypothetical protein  24.29 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00164793  hitchhiker  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4223  ribonuclease E  50 
 
 		 1053 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3081  glycoside hydrolase family protein  52 
 
 		 1149 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0499  transcription termination factor Rho  60.87 
 
 		 497 aa  46.2  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000619502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  35.85 
 
 		 2449 aa  45.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0752  hypothetical protein  42.31 
 
 		 315 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0183997  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0991  ribonuclease  37.5 
 
 		 1059 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  41.07 
 
 		 3521 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>