More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1173 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1173  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 445 aa  854    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 3145 aa  201  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  39 
 
 		 626 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 542 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 740 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  35.19 
 
 		 473 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 		 472 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  36.66 
 
 		 649 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  35.06 
 
 		 1677 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  36.66 
 
 		 649 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 		 574 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  34.23 
 
 		 1077 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  37.59 
 
 		 614 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  37.59 
 
 		 614 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  37.59 
 
 		 626 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  37.59 
 
 		 614 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  37.59 
 
 		 614 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  37.59 
 
 		 626 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 1005 aa  176  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 614 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  34.98 
 
 		 714 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 		 620 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  37.81 
 
 		 620 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 639 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 		 646 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  37.24 
 
 		 636 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 		 612 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  34.84 
 
 		 577 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 689 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 636 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 1212 aa  167  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  36.12 
 
 		 637 aa  167  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 523 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 615 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  31.49 
 
 		 935 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 		 635 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 		 635 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  34.66 
 
 		 502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 		 502 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 		 611 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.79 
 
 		 1034 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  34.19 
 
 		 502 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 1450 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  35.02 
 
 		 578 aa  163  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 		 529 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  33.19 
 
 		 923 aa  160  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 662 aa  160  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  33.41 
 
 		 505 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  34.93 
 
 		 1451 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 		 1827 aa  157  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1038 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  34.93 
 
 		 1454 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 780 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  33.26 
 
 		 648 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 955 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.21 
 
 		 760 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 601 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  30.45 
 
 		 653 aa  153  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 		 546 aa  153  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 		 653 aa  153  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  33.26 
 
 		 608 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0304  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.28 
 
 		 646 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.860081  normal  0.111747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  35.62 
 
 		 714 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 688 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  29.6 
 
 		 615 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 527 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 607 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  33.24 
 
 		 1073 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 602 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 592 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 		 747 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 558 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 637 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 767 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 		 556 aa  143  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  33 
 
 		 872 aa  142  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2057  hypothetical protein  36.53 
 
 		 541 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2193  hypothetical protein  36.53 
 
 		 552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257846  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 481 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  32.41 
 
 		 503 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  30.3 
 
 		 1764 aa  140  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 451 aa  139  8.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  31.97 
 
 		 540 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  31.14 
 
 		 703 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3429  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.29 
 
 		 530 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.03 
 
 		 603 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 595 aa  137  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  32.29 
 
 		 550 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 559 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0551  TPR domain-containing protein  35.99 
 
 		 541 aa  133  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475712  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2921  TPR repeat-containing protein  35.22 
 
 		 389 aa  133  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  29.2 
 
 		 525 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 681 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  34.53 
 
 		 360 aa  131  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.93 
 
 		 512 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.7 
 
 		 454 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  34.42 
 
 		 546 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 		 545 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 747 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>