More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0106 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0106  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
265 aa  480  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.233212  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.98 
 
 
632 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
878 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
810 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
1737 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0077  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
390 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.01 
 
 
2240 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
718 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 
465 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
573 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
1252 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
1252 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
681 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 
362 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
955 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
3035 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.05 
 
 
565 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1344  hypothetical protein  30.15 
 
 
641 aa  63.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527129  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
673 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
3145 aa  62.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  36.26 
 
 
1677 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
762 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
1276 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
4079 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.3 
 
 
620 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 
909 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
4489 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.7 
 
 
1979 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.03 
 
 
725 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  39.1 
 
 
626 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 
685 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 
1694 aa  58.9  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  31.61 
 
 
875 aa  58.9  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 
592 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  34.64 
 
 
576 aa  58.9  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.42 
 
 
764 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 
1094 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 
714 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
750 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
620 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.53 
 
 
626 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.22 
 
 
512 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 
614 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 
614 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
393 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  48.53 
 
 
864 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  31.43 
 
 
535 aa  55.8  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 
317 aa  55.8  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
636 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  36.3 
 
 
776 aa  55.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  34.87 
 
 
614 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  34.87 
 
 
626 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
637 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 
968 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 
614 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  36.96 
 
 
714 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 
708 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  34.87 
 
 
614 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
3172 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
505 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 
739 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
927 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.95 
 
 
816 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
615 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
639 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.9 
 
 
689 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  32.69 
 
 
882 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 
543 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 
637 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.16 
 
 
887 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 
602 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 
274 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 
612 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  32.53 
 
 
882 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 
472 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
311 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.7 
 
 
639 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  28.96 
 
 
299 aa  53.1  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  27.04 
 
 
542 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 
646 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0640  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 
516 aa  52.8  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 
827 aa  53.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  33.11 
 
 
585 aa  52.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 
740 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 
374 aa  52.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.11 
 
 
733 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 
649 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 
649 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  36 
 
 
750 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  32.56 
 
 
795 aa  52.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
3301 aa  52.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.14 
 
 
836 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.86 
 
 
358 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
934 aa  52  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 
611 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 
833 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  47.76 
 
 
608 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.95 
 
 
616 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  43.75 
 
 
366 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 
566 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>