15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0101 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0101  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  388  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1598  hypothetical protein  48.42 
 
 		 190 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3755  hypothetical protein  46.86 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3804  hypothetical protein  46.86 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.81964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1520  hypothetical protein  44.07 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2802  hypothetical protein  41.9 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.137186 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0809  hypothetical protein  47.13 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2569  hypothetical protein  35.91 
 
 		 196 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3537  hypothetical protein  35.91 
 
 		 196 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.993733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0796  hypothetical protein  39.33 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0824  hypothetical protein  39.33 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2305  hypothetical protein  28.4 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3679  hypothetical protein  24 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.744055  hitchhiker  0.00232775 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0022  hypothetical protein  25.19 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2644  hypothetical protein  26.58 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>