More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0017 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0017  undecaprenyl-diphosphatase  100 
 
 
282 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0247  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.96 
 
 
267 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.45 
 
 
266 aa  175  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2821  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.79 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184257  normal  0.392162 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.21 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3593  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.75 
 
 
267 aa  172  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.07 
 
 
266 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.07 
 
 
266 aa  171  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.81 
 
 
266 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.88 
 
 
266 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  40.38 
 
 
266 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
266 aa  170  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.58 
 
 
266 aa  169  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.07 
 
 
267 aa  168  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1293  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.71 
 
 
266 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.05 
 
 
267 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.29 
 
 
266 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.29 
 
 
266 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  41.57 
 
 
269 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  38.97 
 
 
267 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.29 
 
 
266 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.29 
 
 
266 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.46 
 
 
265 aa  163  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.75 
 
 
265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  38.81 
 
 
270 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.13 
 
 
267 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.1 
 
 
266 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.31 
 
 
266 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.41 
 
 
266 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0115  bacitracin resistance protein BacA  43.75 
 
 
268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153231  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0067  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.37 
 
 
264 aa  155  7e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.01 
 
 
265 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.09 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.95 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3783  undecaprenol kinase  40.22 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.261565  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.33 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  38.1 
 
 
261 aa  152  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0633  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.63 
 
 
320 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.395478 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3867  undecaprenol kinase  39.49 
 
 
271 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  39.19 
 
 
261 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.36 
 
 
266 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0387  undecaprenol kinase, putative  39.56 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  38.93 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  38.08 
 
 
279 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3383  putative undecaprenol kinase  39.41 
 
 
290 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  37.28 
 
 
274 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02211  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.36 
 
 
293 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.21 
 
 
292 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.11 
 
 
276 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0358  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.18 
 
 
283 aa  142  5e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.11 
 
 
276 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.11 
 
 
282 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0174  putative undecaprenol kinase  40.36 
 
 
267 aa  142  9e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1734  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.42 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00685278  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  34.17 
 
 
386 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.64 
 
 
276 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  36.17 
 
 
273 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4191  undecaprenol kinase  36.36 
 
 
320 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195911 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.2 
 
 
287 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  32.83 
 
 
264 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.15 
 
 
282 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.22 
 
 
282 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  39.11 
 
 
262 aa  136  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  38.32 
 
 
272 aa  136  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1209  undecaprenol kinase  35.02 
 
 
290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.46 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.893911  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.49 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  34.2 
 
 
279 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2717  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.46 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000013117 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2440  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.46 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204292  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.43 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.68 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2722  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.82 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  40.23 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.84 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2769  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.46 
 
 
259 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.64 
 
 
282 aa  133  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2732  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.09 
 
 
259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000407022  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0708  undecaprenyl-diphosphatase  33.59 
 
 
302 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2479  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.82 
 
 
259 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000149761  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0335  undecaprenol kinase  36.19 
 
 
291 aa  132  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.395953  normal  0.197846 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2586  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.46 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0713308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  37.74 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1834  Bacitracin resistance protein BacA  31.73 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0116  Bacitracin resistance protein BacA  31.5 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.86 
 
 
283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1821  undecaprenyl-diphosphatase  34.78 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0282  Undecaprenyl-diphosphatase  35.04 
 
 
291 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160611 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  34.18 
 
 
277 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16250  Undecaprenyl-diphosphatase  34.95 
 
 
290 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0295918  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06831  bacitracin resistance protein BacA  31.9 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.834409 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09180  Undecaprenyl-diphosphatase  32.62 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.352379  normal  0.402204 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1289  undecaprenyl-diphosphatase  35.79 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.53 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11800  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.51 
 
 
277 aa  127  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.71 
 
 
282 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.77 
 
 
292 aa  126  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.59 
 
 
277 aa  125  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0427  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.91 
 
 
261 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000720891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>