More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4740 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010678  Rpic_4740  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
171 aa  352  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3663  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
171 aa  352  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65018 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1120  GCN5-related N-acetyltransferase  29.56 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000648101 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0840  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000217088  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0565  acetyltransferase  34.29 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00392228  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0342  GCN5-related N-acetyltransferase  28.75 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1307  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0793594  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2161  acetyltransferase  33.64 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.965096  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1060  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1822  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4913  acetyltransferase  27.65 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4516  acetyltransferase  27.65 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3436  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2506  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.611221  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3471  acetyltransferase, gnat family  29.69 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.805737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4499  acetyltransferase  27.65 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4903  acetyltransferase, gnat family  27.65 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00722603  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2470  spermidine N1-acetyltransferase, putative  31 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0215406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3484  acetyltransferase  28.91 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.596039  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3187  acetyltransferase  27.67 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593765  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1712  GCN5-related N-acetyltransferase  38.61 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96373  normal  0.995191 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1724  spermidine acetyltransferase  30.48 
 
 
212 aa  63.9  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0354958  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0291  spermidine n1-acetyltransferase  32.69 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4021  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193056  normal  0.623875 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3274  acetyltransferase  28.91 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.959565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2355  GCN5-related N-acetyltransferase  32.81 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382681  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3488  acetyltransferase, gnat family  28.91 
 
 
183 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3184  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382869  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1177  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 
189 aa  62.4  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  35.05 
 
 
175 aa  61.6  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3338  acetyltransferase  29.05 
 
 
176 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.667425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5241  diamine N-acetyltransferase  30 
 
 
171 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2357  acetyltransferase  30.67 
 
 
191 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1092  acetyltransferase  30.67 
 
 
191 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3240  acetyltransferase  30.67 
 
 
191 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4945  spermidine N1-acetyltransferase  30 
 
 
171 aa  60.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4788  diamine N-acetyltransferase (spermidine acetyltransferase)  30 
 
 
171 aa  60.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2063  acetyltransferase  30.67 
 
 
191 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.475157  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3125  acetyltransferase  30.67 
 
 
191 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1456  acetyltransferase  30.67 
 
 
191 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5323  spermidine N1-acetyltransferase  30 
 
 
171 aa  60.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5190  spermidine N1-acetyltransferase  30 
 
 
171 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1372  acetyltransferase  30.67 
 
 
191 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.519651  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2932  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0153421 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1778  acetyltransferase  28.12 
 
 
183 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.357267  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4806  diamine N-acetyltransferase (spermidine acetyltransferase)  30 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2705  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.172717 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2392  GCN5-related N-acetyltransferase  35.51 
 
 
199 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5224  spermidine N1-acetyltransferase  30 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0945  GCN5-related N-acetyltransferase  26.51 
 
 
179 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1458  Diamine N-acetyltransferase  36.19 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.860085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5220  spermidine N1-acetyltransferase  29 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2827  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  0.971472 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0259  GCN5-related N-acetyltransferase  26.21 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2807  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.208283  normal  0.221461 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0022  diamine N-acetyltransferase  30 
 
 
171 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.246966 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4907  GCN5-related N-acetyltransferase  29 
 
 
171 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0111  diamine N-acetyltransferase  25.31 
 
 
186 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000137834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0126  diamine N-acetyltransferase  25.31 
 
 
186 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3965  GCN5-related N-acetyltransferase  31.73 
 
 
180 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1180  acetyltransferase (GNAT) family protein  32.41 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0317  spermidine n(1)-acetyltransferase  29.81 
 
 
239 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000406096  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4477  putative acetyltransferase  32.04 
 
 
180 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  unclonable  0.00000138966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2943  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.26 
 
 
149 aa  58.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000136246  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3175  GCN5-related N-acetyltransferase  25.15 
 
 
180 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00585025  hitchhiker  0.0000100489 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2543  GCN5-related N-acetyltransferase  25.15 
 
 
180 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00522491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  25.15 
 
 
180 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00189616  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  25.15 
 
 
184 aa  58.2  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0081  spermidine n(1)-acetyltransferase  25.47 
 
 
194 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000286884  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46440  putative acetyltransferase  28.48 
 
 
177 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000264759  hitchhiker  0.000775438 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0120  GCN5-related N-acetyltransferase  27.13 
 
 
181 aa  57.8  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2920  GCN5-related N-acetyltransferase  30.48 
 
 
182 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0655  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
180 aa  57.4  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0717  acetyltransferase  23.9 
 
 
167 aa  57.4  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142894  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0586  GCN5-related N-acetyltransferase  25.62 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.549285  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4008  acetyltransferase  27.88 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2314  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
189 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462132  normal  0.0268854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4063  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 
170 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0980441 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1387  GCN5-related protein N-acetyltransferase  34.62 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292475  normal  0.856464 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001389  spermidine N1-acetyltransferase  27.88 
 
 
180 aa  57  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.091207  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0941  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
330 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.588429 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1085  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
330 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31300  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  31.4 
 
 
203 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00339223  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  24.39 
 
 
180 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111771  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3002  Diamine N-acetyltransferase  29.45 
 
 
186 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.233587  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09204  GNAT family acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14730)  30.94 
 
 
197 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2577  acetyltransferase  24.26 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000295975  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3093  GCN5-related N-acetyltransferase  24.39 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000155938  hitchhiker  0.00420903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4060  GCN5-related N-acetyltransferase  28.92 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2764  acetyltransferase  24.26 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.824722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2771  acetyltransferase, GNAT family  24.26 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0074365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3765  GCN5-related N-acetyltransferase  28.92 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3149  GCN5-related N-acetyltransferase  25.31 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000175005  hitchhiker  0.00000000160471 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2533  acetyltransferase  24.26 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000193156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
182 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0208114  normal  0.245921 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1041  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 
200 aa  55.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0696041  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1604  diamine N-acetyltransferase  31.43 
 
 
186 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1613  diamine N-acetyltransferase  31.43 
 
 
186 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.728332  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1837  diamine N-acetyltransferase  31.43 
 
 
186 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171518  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1672  diamine N-acetyltransferase  31.43 
 
 
186 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.94947  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>