105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4069 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4069  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4181  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02067  hypothetical protein  72.56 
 
 		 255 aa  368  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0742  putative MinD-related protein  31.4 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0133  flagellar biosynthesis protein FlhG  31.82 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2837  flagellar biosynthesis protein, FlhG  30.25 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0270  flagellar biosynthesis protein, FlhG  30.25 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0252  flagellar biosynthesisprotein, FlhG  30.25 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2961  flagellar biosynthesis protein FlhG  27.27 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  0.0900625 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3801  flagellar biosynthesis protein FlhG  30.57 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0178  flagellar biosynthesis protein, FlhG  29.83 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1248  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  30.83 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3373  flagellar biosynthesisprotein, FlhG  30 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0984  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.03 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0184  flagellar biosynthesisprotein, FlhG  30.25 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1747  hypothetical protein  24.2 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1747  hypothetical protein  24.2 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5618  flagellar biosynthesis protein FlhG  33.33 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81162  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1198  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.81 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000520334  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45640  flagellar synthesis regulator FleN  28.08 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555509  normal  0.237681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3873  flagellar synthesis regulator FleN  28.08 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.13 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.36 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292285  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3211  flagellar biosynthetic protein FlhG  25.81 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2910  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.81 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.81 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0524451  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.86 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0384925  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3052  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.81 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.81 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0197  flagellar biosynthesisprotein, FlhG  29.41 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.302585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2560  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.110554  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2291  flagellar biosynthesis protein FlhG (flagellar number regulator)  26.39 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1382  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.19 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0481328  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4143  flagellar biosynthesis protein FlhG  29.66 
 
 		 300 aa  62  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.439428  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1298  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.206017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1358  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  0.103677 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.19 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.483613  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2806  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.24 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.992955  normal  0.186543 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1634  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4342  flagellar number regulator FleN  28.77 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422536  normal  0.723195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.44123  normal  0.658899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3050  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.39 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.905912  normal  0.0847945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3911  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.77 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3668  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.77 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0704909  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2844  flagellar biosynthesis protein FlhG, putative  29.41 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0060  flagellar biosynthesis protein FlhG  29.41 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3167  flagellar biosynthesis protein FlhG, putative  28.99 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3420  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  29.41 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1698  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  29.41 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3841  putative flagellar protein  29.41 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3922  putative flagellar protein  29.41 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3131  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  29.41 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1978  flagellar synthesis regulator FleN  28.08 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3438  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.08 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.704285  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.29 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02871  flagellar biosynthetic protein FlhG  25.86 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00958  flagellar synthesis regulator FleN  21.79 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.275874  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06208  flagellar synthesis regulator FleN  21.79 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121136  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1562  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.4 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100295  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1947  hypothetical protein  32.97 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03145  hypothetical protein  26.39 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0478  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.38 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3031  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.28 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.24 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002831  flagellar synthesis regulator FleN  26.61 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000517997  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.16 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2156  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.55 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  21.05 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2390  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.52 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1655  ParA family protein  26.23 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000026019  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1863  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.37 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0949609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1313  NifH/FrxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.18 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2165  flagellar number regulator FleN  25.89 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.19 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.21 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.21 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1518  flagellar biosynthetic protein FlhG  22.5 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.91 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3038  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.45 
 
 		 343 aa  52.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.7 
 
 		 301 aa  52.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.97 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192036  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30460  flagellar number regulator; FleN  26.4 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  23.49 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3701  flagellar biosynthesis protein FlhG  29.75 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216726  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.16 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3469  flagellar synthesis regulator FleN  27.27 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 		 519 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4109  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.41 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.56 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1415  flagellar number regulator  26.09 
 
 		 280 aa  49.3  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.682888  normal  0.589632 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.74 
 
 		 309 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  21.13 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0382  flagellar synthesis regulator FleN  27.27 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.928835  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  25.56 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2012  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.64 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.95 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.92 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0158  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.35 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.726569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>