284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3205 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1806  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  71.95 
 
 		 460 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.557352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3649  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  71.95 
 
 		 460 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2858  Cytochrome b/b6 domain protein  99.14 
 
 		 466 aa  924    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702367  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2928  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  94.19 
 
 		 467 aa  825    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  72.38 
 
 		 460 aa  687    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2697  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  71.95 
 
 		 460 aa  638    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  71.08 
 
 		 433 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  75.71 
 
 		 466 aa  671    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3092  cytochrome b/b6, N-terminal  84.95 
 
 		 467 aa  780    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3674  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  71.95 
 
 		 460 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456535  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  71.95 
 
 		 459 aa  685    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  71.73 
 
 		 460 aa  683    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2976  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  72.16 
 
 		 460 aa  649    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235665  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3706  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  71.95 
 
 		 460 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  71.22 
 
 		 466 aa  695    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  73.03 
 
 		 466 aa  674    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  73.18 
 
 		 459 aa  691    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2742  cytochrome b/b6 domain-containing protein  73.66 
 
 		 460 aa  681    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3229  cytochrome b/b6-like protein  84.95 
 
 		 467 aa  786    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  72.26 
 
 		 459 aa  683    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  71.95 
 
 		 460 aa  684    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3257  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  71.95 
 
 		 460 aa  638    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3205  Cytochrome b/b6 domain  100 
 
 		 466 aa  932    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  71.95 
 
 		 460 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2747  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  71.95 
 
 		 460 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.936741  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  72.16 
 
 		 460 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  71.64 
 
 		 466 aa  683    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  71.95 
 
 		 459 aa  681    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0931  cytochrome b/b6 domain-containing protein  74.51 
 
 		 467 aa  664    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  68.78 
 
 		 470 aa  644    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5502  cytochrome b/b6 domain-containing protein  72.63 
 
 		 471 aa  633  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1201  Cytochrome b/b6 domain protein  72.28 
 
 		 478 aa  632  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3695  cytochrome b/b6 domain-containing protein  72.17 
 
 		 472 aa  626  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.721065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0790  cytochrome b/b6 domain-containing protein  70.06 
 
 		 473 aa  625  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0753  Cytochrome b/b6 domain protein  70.87 
 
 		 473 aa  622  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  71.46 
 
 		 422 aa  622  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0714  cytochrome b/b6 domain-containing protein  72.17 
 
 		 469 aa  618  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455479 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2965  cytochrome b/b6-like  70.74 
 
 		 466 aa  610  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  66.15 
 
 		 410 aa  601  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  60.98 
 
 		 403 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  60.75 
 
 		 403 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  60.22 
 
 		 414 aa  555  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  62.17 
 
 		 410 aa  545  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  59.23 
 
 		 747 aa  531  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  59.69 
 
 		 403 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  60.13 
 
 		 403 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  59.91 
 
 		 404 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  59.91 
 
 		 404 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  59.17 
 
 		 408 aa  526  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  59.69 
 
 		 404 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  59.24 
 
 		 403 aa  525  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  59.25 
 
 		 403 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  59.91 
 
 		 403 aa  518  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  57.14 
 
 		 410 aa  512  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  61.31 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  55.3 
 
 		 426 aa  509  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  60.18 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3275  cytochrome b/b6 domain-containing protein  58.5 
 
 		 404 aa  502  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000010071  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3888  cytochrome b/b6 domain-containing protein  58.28 
 
 		 404 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3762  cytochrome b/b6 domain-containing protein  58.28 
 
 		 404 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000150358  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3020  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  58.5 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000159127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  56.07 
 
 		 459 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0609  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  57.62 
 
 		 404 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  56.04 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4439  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  54.87 
 
 		 423 aa  490  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0795  cytochrome b/b6 domain-containing protein  57.74 
 
 		 410 aa  489  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3705  Cytochrome b/b6 domain protein  58.06 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000382146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4165  cytochrome b/b6 domain-containing protein  58.28 
 
 		 404 aa  490  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000192419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0563  cytochrome b/b6 domain-containing protein  58.06 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000189636  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0571  cytochrome b/b6 domain-containing protein  57.62 
 
 		 404 aa  488  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000252718  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0603  cytochrome b/b6 domain-containing protein  57.84 
 
 		 404 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000103095  normal  0.0561448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3427  cytochrome b/b6 domain-containing protein  57.84 
 
 		 404 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000389785  normal  0.0470542 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  57.84 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0602  cytochrome b/b6 domain-containing protein  57.62 
 
 		 404 aa  491  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000576389  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  57.62 
 
 		 404 aa  485  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623655  hitchhiker  0.00979374 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3535  cytochrome b/b6 domain-containing protein  57.4 
 
 		 404 aa  484  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000787876  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  53.2 
 
 		 404 aa  480  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  52.98 
 
 		 404 aa  479  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3200  cytochrome b/b6-like protein  57.4 
 
 		 404 aa  479  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201205  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1421  cytochrome b, b6 subunit  55.23 
 
 		 401 aa  473  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133027  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1584  cytochrome b/b6-like  55.9 
 
 		 401 aa  474  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.385225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00884  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  54.97 
 
 		 421 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2661  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  54.03 
 
 		 422 aa  462  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00823249  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0106  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  53.91 
 
 		 421 aa  464  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000729315  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004508  ubiquinol--cytochrome c reductase cytochrome B subunit  54.55 
 
 		 421 aa  464  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000136312  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03380  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome B  51.69 
 
 		 421 aa  455  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000214101  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  49.67 
 
 		 410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00440  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome B subunit  53.09 
 
 		 419 aa  442  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121242  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3700  cytochrome b/b6-like  50.21 
 
 		 422 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1362  Cytochrome b/b6 domain  55 
 
 		 419 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.367822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1944  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome B subunit  46.96 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0553456  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1879  cytochrome b/b6 domain-containing protein  47.17 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135906  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  46.93 
 
 		 401 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  44.52 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  45.57 
 
 		 426 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2730  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  44.81 
 
 		 404 aa  364  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187395  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2352  Cytochrome b/b6 domain  44.81 
 
 		 404 aa  364  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.16814  hitchhiker  0.00000000117794 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  44.28 
 
 		 429 aa  363  3e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1540  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.52 
 
 		 426 aa  362  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  43.64 
 
 		 426 aa  362  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>