60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3169 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3169  plasmid maintenance system killer  100 
 
 		 98 aa  200  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0238227  unclonable  0.0000000000000109044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1080  plasmid maintenance system killer  31.52 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1061  plasmid maintenance system killer  37.23 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000720973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4191  plasmid maintenance system killer  34.09 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0717347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3186  plasmid maintenance system killer  35.79 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0260939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6219  plasmid maintenance system killer  34.57 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3199  plasmid maintenance system killer  34.72 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0833  plasmid maintenance system killer  47.27 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4677  plasmid maintenance system killer  33.77 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0978715  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5480  plasmid maintenance system killer  33.77 
 
 		 91 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1586  killer protein, putative  32.95 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2020  plasmid maintenance system killer  35.11 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2650  plasmid maintenance system killer  46.94 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.839642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0275  plasmid maintenance system killer  46.94 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292531  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3242  plasmid maintenance system killer  32.93 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1092  hypothetical protein  37.31 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2105  plasmid maintenance system killer  32.95 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0223  plasmid maintenance system killer  34.09 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.642238  normal  0.270748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1215  plasmid maintenance system killer  30.12 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1257  plasmid maintenance system killer  43.64 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0146502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4369  plasmid maintenance system killer  29.59 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0624655  normal  0.0363881 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1212  plasmid maintenance system killer  31.96 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03904  plasmid maintenance system killer protein  36.84 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6420  plasmid maintenance system killer  36.84 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.953679 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2851  plasmid maintenance system killer  35.06 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0902  hypothetical protein  36.84 
 
 		 199 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2880  plasmid maintenance system killer  39.39 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4140  plasmid maintenance system killer  50 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1064  plasmid maintenance system killer  46.94 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1124  plasmid maintenance system killer  33.77 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0607  plasmid maintenance system killer  30.61 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1668  plasmid maintenance system killer  39.39 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.856327 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0413  plasmid maintenance system killer  30.61 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4827  plasmid maintenance system killer  31.91 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2973  plasmid maintenance system killer  36.36 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3226  plasmid maintenance system killer  35.29 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3425  plasmid maintenance system killer  31.25 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.835038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4755  plasmid maintenance system killer  39.39 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4147  plasmid maintenance system killer  31.91 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.813098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2694  plasmid maintenance system killer  32.98 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1907  plasmid maintenance system killer  30.61 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000193605  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0767  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1670  plasmid maintenance system killer protein  32.1 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.137882  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1386  plasmid maintenance system killer  29.63 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0534  AAA family ATPase  32.1 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.943308  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0020  plasmid maintenance system killer  34.02 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184323  normal  0.0200834 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0673  plasmid maintenance system killer protein  44.19 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.139891  normal  0.666282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2928  plasmid maintenance system killer  34.33 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.133815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2895  plasmid maintenance system killer  34.85 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541001 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4132  plasmid maintenance system killer  31.94 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0858239  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3069  plasmid maintenance system killer  38.81 
 
 		 93 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0643  hypothetical protein  29.85 
 
 		 94 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000101357  normal  0.456148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4028  plasmid maintenance system killer  36.36 
 
 		 94 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1488  hypothetical protein  29.59 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000964732  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3615  plasmid maintenance system killer  36.36 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.443505  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2762  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2424  plasmid maintenance system killer  32.39 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27680  Plasmid maintenance system killer protein  38.3 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2941  plasmid maintenance system killer  31.82 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00442539  hitchhiker  0.00124461 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3069  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 92 aa  40  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>