44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2736 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2736  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  296  8e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.915643  normal  0.816191 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1501  hypothetical protein  50.94 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.787419  normal  0.0723582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5057  hypothetical protein  49.38 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6319  hypothetical protein  50.92 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1760  hypothetical protein  50.92 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6280  hypothetical protein  57.05 
 
 		 149 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0651  hypothetical protein  45.86 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2600  hypothetical protein  42.41 
 
 		 186 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.716222  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0281  hypothetical protein  43.67 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0982  hypothetical protein  43.67 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2680  hypothetical protein  43.67 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2396  hypothetical protein  43.67 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.344878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0819  hypothetical protein  43.67 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0009  hypothetical protein  43.67 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0823  hypothetical protein  43.04 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.253243  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1773  hypothetical protein  49.69 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4315  hypothetical protein  48.53 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1845  hypothetical protein  43.75 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14380  hypothetical protein  46 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0723712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1239  hypothetical protein  46.15 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0503  hypothetical protein  37.01 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0492  hypothetical protein  36.71 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.702213  normal  0.0712002 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0994  hypothetical protein  41.18 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2754  P-18 protein  31.33 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4897  hypothetical protein  33.75 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4950  hypothetical protein  33.75 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4956  hypothetical protein  33.75 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0252301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4863  hypothetical protein  33.75 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3656  hypothetical protein  35.35 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0864  hypothetical protein  35.35 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3527  hypothetical protein  35.35 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04237  hypothetical protein  32.5 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00255693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04203  hypothetical protein  32.5 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00223356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3637  conserved hypothetical protein  32.5 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000262647  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1916  hypothetical protein  38.14 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.274823 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4592  hypothetical protein  32.5 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000005798  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4953  hypothetical protein  32.5 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000310111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4900  hypothetical protein  32.5 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000460742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3695  hypothetical protein  32.5 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000118901  hitchhiker  0.00917885 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4796  hypothetical protein  34.96 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.608299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5873  hypothetical protein  31.87 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.002117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0515  hypothetical protein  29.75 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0489  P-18 protein  34.38 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4905  hypothetical protein  30.3 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000354937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>