More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1536 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1536  type II secretion system protein E  100 
 
 		 528 aa  1082    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.151056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5201  type II secretion system protein E  100 
 
 		 528 aa  1082    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5028  type II secretion system protein E  46.2 
 
 		 609 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5434  type II secretion system protein E  46.2 
 
 		 609 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5912  type II secretion system protein E  31.55 
 
 		 544 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444946  decreased coverage  0.00648046 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5877  type II secretion system protein E  30.62 
 
 		 506 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5660  type II secretion system protein E  30.14 
 
 		 594 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472724  normal  0.0115974 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5448  type II secretion system protein E  29.72 
 
 		 520 aa  150  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40051  normal  0.0905589 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2254  type IV pilus protein PilQ  29.9 
 
 		 536 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5243  type II secretion system protein E  28.48 
 
 		 518 aa  150  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2170  type IV pilus protein PilQ  29.9 
 
 		 536 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284038  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0653  type II/IV secretion system protein  29.9 
 
 		 536 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0772  type II/IV secretion system protein  29.43 
 
 		 538 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182118  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1982  type II/IV secretion system protein  30.24 
 
 		 536 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288567  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1607  type II/IV secretion system protein  30.24 
 
 		 536 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0464448  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0661  type II/IV secretion system protein  30.24 
 
 		 536 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.368751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59290  type IV B pilus protein  28.4 
 
 		 526 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00365421  hitchhiker  0.000000107919 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0063  putative type IV secretion system protein PilQ  25.77 
 
 		 510 aa  147  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4474  hypothetical protein  27.7 
 
 		 513 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0017  type IV pilus biosynthesis protein PilQ  24.17 
 
 		 499 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  29.01 
 
 		 565 aa  133  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1514  type II secretion system protein E  25.98 
 
 		 543 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0886  type II secretion system protein E  35.59 
 
 		 571 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  28.78 
 
 		 891 aa  128  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  32.36 
 
 		 871 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  32.23 
 
 		 746 aa  127  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0114  ATP-binding protein  25.05 
 
 		 517 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2419  type II secretion system protein E  35.98 
 
 		 559 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0585  type II secretion system protein E  29.61 
 
 		 392 aa  125  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2722  type II secretion system protein E  24.31 
 
 		 502 aa  124  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3731  type IV secretion system protein  25.85 
 
 		 517 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  28.5 
 
 		 567 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  36.64 
 
 		 585 aa  121  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  29.06 
 
 		 554 aa  121  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  33.21 
 
 		 578 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  29.9 
 
 		 582 aa  120  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0651  hypothetical protein  28.76 
 
 		 461 aa  120  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.796568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  28.14 
 
 		 557 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  29.37 
 
 		 568 aa  120  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0163  hypothetical protein  27.08 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104571  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  33.46 
 
 		 564 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  30.37 
 
 		 577 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0160  hypothetical protein  27.32 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  30.69 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  35.69 
 
 		 553 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0155  hypothetical protein  27.08 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  32.96 
 
 		 561 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1434  type II secretion system protein E  34.75 
 
 		 558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  27.4 
 
 		 546 aa  119  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3880  type II secretion system protein E  36.13 
 
 		 567 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  33.76 
 
 		 555 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0157  hypothetical protein  27.08 
 
 		 461 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.208845 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  35.15 
 
 		 553 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.13 
 
 		 571 aa  118  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2744  type II secretion system protein E  30.6 
 
 		 527 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.322952 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  32.46 
 
 		 605 aa  118  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0156  hypothetical protein  27.86 
 
 		 461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.836049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1982  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 573 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981524  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  26.29 
 
 		 578 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0113  hypothetical protein  28.78 
 
 		 461 aa  117  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00764351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2588  type II secretion system protein E  30.51 
 
 		 599 aa  117  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  33.9 
 
 		 558 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  27.78 
 
 		 566 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  34.44 
 
 		 575 aa  116  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3483  type II secretion system protein E  33.47 
 
 		 598 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2308  putative GSPE-related protein  29.57 
 
 		 567 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173672 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  27.97 
 
 		 558 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  30.41 
 
 		 568 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2288  type II secretion system protein E  33.47 
 
 		 598 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0404074  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  26.71 
 
 		 573 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0109  hypothetical protein  28.78 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000141775  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3223  type II secretion system protein E  30.8 
 
 		 564 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1295  type II secretion system protein  33.73 
 
 		 566 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00227246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  32.07 
 
 		 885 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  28.03 
 
 		 576 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0626  hypothetical protein  28.16 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  34.75 
 
 		 596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0111  hypothetical protein  28.78 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000253922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  27.62 
 
 		 573 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  27.17 
 
 		 727 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  32.75 
 
 		 888 aa  115  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  27.64 
 
 		 570 aa  115  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00106  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  28.78 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3495  type II secretion system protein E  28.78 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00105  hypothetical protein  28.78 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  35.42 
 
 		 577 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  27.32 
 
 		 599 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  34.6 
 
 		 611 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  33.63 
 
 		 611 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  33.63 
 
 		 611 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3552  hypothetical protein  28.78 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180133 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  33.33 
 
 		 497 aa  114  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  26.98 
 
 		 568 aa  114  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  27.59 
 
 		 494 aa  114  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0110  hypothetical protein  28.78 
 
 		 461 aa  114  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157109  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  33.33 
 
 		 497 aa  114  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.41 
 
 		 568 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  28.78 
 
 		 417 aa  114  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.41 
 
 		 568 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2614  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 580 aa  113  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.574914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>