68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1513 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1513  flagellar transcriptional activator  100 
 
 		 114 aa  223  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5178  flagellar transcriptional activator  100 
 
 		 100 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1413  transcriptional activator FlhD  40.24 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526559 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4043  transcriptional activator FlhD  40.24 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4155  transcriptional activator FlhD  40.24 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3685  transcriptional activator FlhD  43.24 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0479356 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0233  transcriptional activator FlhD  45 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0251  transcriptional activator FlhD  45 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.272969  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3353  transcriptional activator FlhD  45 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719466  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0164  transcriptional activator FlhD  43.75 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0177  transcriptional activator FlhD  43.75 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3440  transcriptional activator FlhD  38.1 
 
 		 222 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5604  transcriptional activator FlhD  41.89 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.231239  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0082  transcriptional activator FlhD  38.1 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3187  transcriptional activator FlhD  42.5 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0821946  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2864  transcriptional activator FlhD  42.5 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3111  transcriptional activator FlhD  42.5 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3941  transcriptional activator FlhD  42.5 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.922681  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3860  transcriptional activator FlhD  42.5 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1679  transcriptional activator FlhD  42.5 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.614234  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1305  transcriptional activator FlhD  35 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2856  transcriptional activator FlhD  43.75 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17963  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0160  transcriptional activator FlhD  42.5 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3820  transcriptional activator FlhD  44.3 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.173639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0114  transcriptional activator FlhD  44.3 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2979  transcriptional activator FlhD  34.38 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000641215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1196  transcriptional activator FlhD  39.73 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000242904  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1319  transcriptional activator FlhD  39.73 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102407  hitchhiker  1.2450300000000001e-24 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1536  transcriptional activator FlhD  36.71 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00409913  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2081  transcriptional activator FlhD  38.89 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000102122  decreased coverage  0.000000325963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2141  transcriptional activator FlhD  38.89 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000294408  hitchhiker  1.8448199999999999e-31 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2086  transcriptional activator FlhD  38.89 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000128662  unclonable  1.32042e-30 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4211  transcriptional activator FlhD  36.59 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2631  transcriptional activator FlhD  36.71 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000042575  decreased coverage  0.00000000000000177734 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1508  transcriptional activator FlhD  35.44 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00168962  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1851  transcriptional activator FlhD  36.11 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00649887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2615  transcriptional activator FlhD  36.11 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00174492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2989  transcriptional activator FlhD  37.5 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01852  hypothetical protein  38.57 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1740  transcriptional activator FlhD  38.57 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.140551  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1748  flagellar transcriptional activator  38.57 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00200339  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1634  transcriptional activator FlhD  37.5 
 
 		 116 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1988  transcriptional activator FlhD  38.57 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.83852e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2125  transcriptional activator FlhD  38.57 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000669135  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01863  transcriptional activator FlhD  38.57 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0964972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1292  transcriptional activator FlhD  38.57 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000962983  hitchhiker  0.0000000541956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1745  transcriptional activator FlhD  37.5 
 
 		 116 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0465343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1690  flagellar transcriptional activator  36.25 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0151  flagellar transcriptional activator  37.18 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2006  flagellar transcriptional activator, FlhD subunit  31.91 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0823929  hitchhiker  0.00228476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3229  flagellar transcriptional activator  37.5 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2470  transcriptional activator FlhD  35.71 
 
 		 119 aa  50.1  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000162206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1943  transcriptional activator FlhD  27.62 
 
 		 105 aa  50.1  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1240  transcriptional activator FlhD  32.05 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2028  putative flagellar transcriptional activator transcription regulator protein  33.8 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00113086  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1005  flagellar transcriptional activator  35.9 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2884  flagellar transcriptional activator, FlhD subunit  34.12 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0514337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24300  flagellar transcriptional activator  36.62 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.757302  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2371  flagellar transcriptional activator  34.12 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.290285  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7083  transcriptional activator FlhD  30.86 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3700  flagellar transcriptional activator FlhD  32.5 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1860  flagellar transcriptional activator, FlhD subunit  35.62 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.309366  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2869  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4639  transcriptional activator FlhD  32.35 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187238  normal  0.541789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4544  transcriptional activator FlhD  33.33 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0858  transcriptional activator FlhD  33.33 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0428294 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4160  flagellar transcriptional activator  31.25 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2236  flagellar transcriptional activator  32.1 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489857  normal  0.0382615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>