14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1397 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1397  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  700    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0213294  normal  0.869405 
 
 
-
 
NC_003296  RS05555  hypothetical protein  80.85 
 
 		 97 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3271  hypothetical protein  33.09 
 
 		 259 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3907  putative bacteriophage-related protein  33.58 
 
 		 260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2351  hypothetical protein  32.75 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4350  hypothetical protein  33.19 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00630082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4488  hypothetical protein  31.38 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.26168  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2142  hypothetical protein  34.42 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0288655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2549  hypothetical protein  31.6 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1456  hypothetical protein  32.26 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0289256 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3595  hypothetical protein  30.38 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465668  decreased coverage  0.00093733 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0617  hypothetical protein  33.15 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.419644 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1232  hypothetical protein  28.81 
 
 		 252 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1419  hypothetical protein  26.71 
 
 		 284 aa  42.7  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.541352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>