More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0969 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02625  CTP synthetase  61.36 
 
 		 545 aa  684    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000505271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0908  CTP synthase  61.36 
 
 		 545 aa  684    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000342907  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2127  CTP synthetase  81.14 
 
 		 552 aa  915    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0913295  normal  0.042023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  64.17 
 
 		 542 aa  725    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3447  CTP synthetase  61.72 
 
 		 545 aa  687    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125216  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  65.94 
 
 		 552 aa  735    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1126  CTP synthetase  95.31 
 
 		 554 aa  1075    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.116547 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  57.22 
 
 		 553 aa  637    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4108  CTP synthetase  62.89 
 
 		 542 aa  702    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  63.67 
 
 		 542 aa  717    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2653  CTP synthetase  68.19 
 
 		 554 aa  785    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.476334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  64.1 
 
 		 545 aa  707    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  63.37 
 
 		 546 aa  694    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  63.45 
 
 		 543 aa  711    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  64.17 
 
 		 542 aa  725    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3084  CTP synthetase  61.36 
 
 		 545 aa  684    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000646787  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2924  CTP synthetase  61.36 
 
 		 545 aa  684    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000016445  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1691  CTP synthetase  81.92 
 
 		 553 aa  933    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  62.61 
 
 		 545 aa  688    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  62.61 
 
 		 545 aa  689    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  63.45 
 
 		 543 aa  712    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1641  CTP synthetase  62.75 
 
 		 544 aa  689    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118223  hitchhiker  0.0000254043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  70.2 
 
 		 546 aa  797    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  64.08 
 
 		 555 aa  734    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0980  CTP synthetase  61.72 
 
 		 545 aa  687    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0184119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1088  CTP synthetase  90.84 
 
 		 550 aa  1021    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  69.71 
 
 		 546 aa  785    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  64.17 
 
 		 542 aa  725    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  61.82 
 
 		 543 aa  696    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2713  CTP synthetase  81.92 
 
 		 553 aa  933    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0850  CTP synthetase  64.17 
 
 		 550 aa  717    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  64.23 
 
 		 543 aa  726    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0218  CTP synthetase  68.14 
 
 		 557 aa  770    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.682216 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0566  CTP synthetase  59.67 
 
 		 554 aa  681    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5415  CTP synthetase  81.5 
 
 		 550 aa  918    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.295707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0932  CTP synthetase  61.36 
 
 		 545 aa  684    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000109112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0945  CTP synthetase  81.92 
 
 		 553 aa  927    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0614  CTP synthetase  59.49 
 
 		 554 aa  680    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  57.07 
 
 		 548 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  63.82 
 
 		 543 aa  732    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  63.72 
 
 		 555 aa  728    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  63.74 
 
 		 545 aa  697    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000222232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  63.97 
 
 		 544 aa  692    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1227  CTP synthetase  69.56 
 
 		 566 aa  761    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  64.1 
 
 		 546 aa  704    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2019  CTP synthetase  82.05 
 
 		 552 aa  923    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0440235 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1892  CTP synthetase  81.56 
 
 		 553 aa  929    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  59.53 
 
 		 555 aa  648    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2026  CTP synthetase  64.29 
 
 		 545 aa  714    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406175  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  63.74 
 
 		 545 aa  697    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  64.88 
 
 		 546 aa  716    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  62.86 
 
 		 551 aa  719    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2648  CTP synthetase  69.72 
 
 		 555 aa  798    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  60.18 
 
 		 543 aa  693    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  64.1 
 
 		 543 aa  727    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  72.89 
 
 		 542 aa  840    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3181  CTP synthetase  68.81 
 
 		 563 aa  793    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1571  CTP synthetase  81.74 
 
 		 557 aa  929    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.465584  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  63.92 
 
 		 545 aa  704    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0899  CTP synthetase  82.39 
 
 		 558 aa  922    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.995561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  64.56 
 
 		 548 aa  718    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  58.74 
 
 		 555 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1875  CTP synthetase  62.75 
 
 		 544 aa  692    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000103989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1052  CTP synthetase  90.13 
 
 		 549 aa  1018    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0222  CTP synthetase  60.88 
 
 		 543 aa  690    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.555048  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  63.8 
 
 		 542 aa  722    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  71.01 
 
 		 555 aa  807    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5105  CTP synthetase  66.18 
 
 		 552 aa  775    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5968  CTP synthetase  80.95 
 
 		 552 aa  914    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3317  CTP synthetase  61.72 
 
 		 545 aa  687    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00384789  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3265  CTP synthetase  61.82 
 
 		 543 aa  685    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1161  CTP synthetase  82.05 
 
 		 553 aa  922    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650114 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2579  CTP synthetase  81.92 
 
 		 570 aa  934    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  63.74 
 
 		 545 aa  697    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0552  CTP synthetase  63.4 
 
 		 542 aa  699    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1114  CTP synthetase  63.74 
 
 		 546 aa  695    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000131384  normal  0.869869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1185  CTP synthetase  63.74 
 
 		 546 aa  699    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000285694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  64.65 
 
 		 540 aa  733    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1051  CTP synthetase  63 
 
 		 545 aa  694    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333074  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  61.9 
 
 		 545 aa  690    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1289  CTP synthetase  63.74 
 
 		 545 aa  702    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.934915  hitchhiker  0.00000000280114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2146  CTP synthetase  81.87 
 
 		 552 aa  923    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  63.67 
 
 		 542 aa  717    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2633  CTP synthetase  81.92 
 
 		 553 aa  933    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267072  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0794  CTP synthetase  61.54 
 
 		 545 aa  689    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0895398  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2109  CTP synthetase  80.95 
 
 		 552 aa  914    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532575  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3351  CTP synthetase  64.1 
 
 		 545 aa  696    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000138422  hitchhiker  0.0000252338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  63.74 
 
 		 546 aa  696    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2918  CTP synthetase  61.36 
 
 		 545 aa  684    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000134002  normal  0.938704 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3123  CTP synthetase  81.74 
 
 		 553 aa  932    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839664  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  63.74 
 
 		 545 aa  697    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000221418  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  65.33 
 
 		 545 aa  728    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  60.62 
 
 		 545 aa  705    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  64.48 
 
 		 542 aa  740    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1176  CTP synthetase  68.56 
 
 		 563 aa  775    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.413679 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1327  CTP synthetase  69.45 
 
 		 559 aa  806    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1185  CTP synthetase  68.6 
 
 		 566 aa  793    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1000  CTP synthetase  67.03 
 
 		 552 aa  784    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1468  CTP synthetase  81.92 
 
 		 553 aa  933    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2195  CTP synthetase  81.92 
 
 		 553 aa  933    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>