54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0274 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0274  protein of unknown function DUF355  100 
 
 		 161 aa  327  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0301  protein of unknown function DUF355  99.38 
 
 		 161 aa  324  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0419  hypothetical protein  94.41 
 
 		 161 aa  312  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.292052  normal  0.670063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3210  protein of unknown function DUF355  93.79 
 
 		 161 aa  310  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1587  hypothetical protein  93.17 
 
 		 171 aa  310  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0366  hypothetical protein  79.5 
 
 		 161 aa  272  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5336  hypothetical protein  82.61 
 
 		 161 aa  271  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00233942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3690  protein of unknown function DUF355  72.05 
 
 		 161 aa  253  9e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1110  hypothetical protein  72.67 
 
 		 162 aa  251  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319253  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6435  hypothetical protein  70.81 
 
 		 161 aa  250  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.246581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5011  hypothetical protein  73.75 
 
 		 162 aa  248  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197453  normal  0.318854 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0037  hypothetical protein  72.5 
 
 		 162 aa  247  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1533  hypothetical protein  72.5 
 
 		 162 aa  246  8e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336849  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0408  hypothetical protein  72.05 
 
 		 161 aa  246  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1036  hypothetical protein  71.88 
 
 		 162 aa  245  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0701522  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1187  hypothetical protein  71.88 
 
 		 162 aa  245  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519761  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0016  hypothetical protein  71.88 
 
 		 162 aa  245  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0379958  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0396  hypothetical protein  71.88 
 
 		 162 aa  245  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1446  hypothetical protein  71.88 
 
 		 162 aa  245  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951198  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1371  hypothetical protein  70 
 
 		 162 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0906  hypothetical protein  68.94 
 
 		 161 aa  239  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3948  hypothetical protein  68.32 
 
 		 162 aa  239  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.286112 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1811  protein of unknown function DUF355  67.08 
 
 		 162 aa  220  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1347  hypothetical protein  64.6 
 
 		 162 aa  220  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0575797  normal  0.151716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3457  hypothetical protein  68.15 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13767  hypothetical protein  65.61 
 
 		 162 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2404  protein of unknown function DUF355  63.98 
 
 		 160 aa  206  9e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.155969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1660  hypothetical protein  62.73 
 
 		 160 aa  206  9e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2491  protein of unknown function DUF355  63.35 
 
 		 160 aa  206  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0914  protein of unknown function DUF355  61.49 
 
 		 160 aa  205  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0191  hypothetical protein  60.87 
 
 		 160 aa  204  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1458  hypothetical protein  62.73 
 
 		 160 aa  202  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1710  protein of unknown function DUF355  60 
 
 		 162 aa  201  3e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1997  hypothetical protein  59.38 
 
 		 161 aa  201  3e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.104148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2301  protein of unknown function DUF355  55.9 
 
 		 160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.621582  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2249  protein of unknown function DUF355  55.28 
 
 		 160 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1114  hypothetical protein  57.76 
 
 		 160 aa  195  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602577  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2030  protein of unknown function DUF355  57.14 
 
 		 160 aa  190  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0900  protein of unknown function DUF355  52.8 
 
 		 160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0014045  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1652  hypothetical protein  58.28 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0687  protein of unknown function DUF355  55.9 
 
 		 164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1525  hypothetical protein  58.28 
 
 		 164 aa  176  9e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.262148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1459  hypothetical protein  58.28 
 
 		 164 aa  176  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1428  protein of unknown function DUF355  51.85 
 
 		 161 aa  175  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.26943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1185  hypothetical protein  53.12 
 
 		 162 aa  174  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0194411  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0683  hypothetical protein  52.5 
 
 		 163 aa  174  5e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2388  hypothetical protein  53.75 
 
 		 162 aa  171  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000235173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0090  hypothetical protein  51.59 
 
 		 164 aa  170  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0728  hypothetical protein  55.41 
 
 		 163 aa  170  9e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142892  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1022  hypothetical protein  56.44 
 
 		 164 aa  169  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0698369  hitchhiker  5.83418e-20 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0752  hypothetical protein  55.41 
 
 		 163 aa  169  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000863743  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1038  hypothetical protein  54.32 
 
 		 165 aa  167  4e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000804852 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4399  hypothetical protein  51.59 
 
 		 173 aa  161  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.444219  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2837  hypothetical protein  57.5 
 
 		 162 aa  160  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>