22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5232 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5232  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  845    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1568  hypothetical protein  99.75 
 
 		 406 aa  843    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6249  hypothetical protein  52.97 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5585  hypothetical protein  39.75 
 
 		 410 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6533  hypothetical protein  35.31 
 
 		 408 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5425  hypothetical protein  29.12 
 
 		 451 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5361  hypothetical protein  29.75 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0691141 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5030  protein of unknown function DUF1173  30.42 
 
 		 441 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4289  hypothetical protein  27.48 
 
 		 433 aa  126  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4238  hypothetical protein  23.03 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4329  hypothetical protein  22.61 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00310641  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2244  hypothetical protein  23.33 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4994  hypothetical protein  23.5 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6826  hypothetical protein  23.05 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0336179  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1564  hypothetical protein  23.16 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144406  normal  0.0475856 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6244  hypothetical protein  21.9 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1674  hypothetical protein  23.08 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.252915 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4991  hypothetical protein  22.51 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  hitchhiker  0.00100031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2564  hypothetical protein  23.02 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4154  hypothetical protein  22.58 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0603844  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4748  hypothetical protein  23.55 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3958  hypothetical protein  22.33 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>