27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5144 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5144    100 
 
 		 147 bp  291  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3304  putative transposase  97.56 
 
 		 1494 bp  147  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2997  putative transposase  97.56 
 
 		 1494 bp  147  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1464  putative transposase  97.56 
 
 		 1494 bp  147  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3099  integrase catalytic subunit  90.74 
 
 		 1533 bp  67.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.277104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1214  integrase catalytic subunit  90.74 
 
 		 1533 bp  67.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0831  integrase catalytic subunit  90.74 
 
 		 1533 bp  67.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0739  integrase catalytic subunit  90.74 
 
 		 1533 bp  67.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.281393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4201    90.2 
 
 		 1525 bp  61.9  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  88.24 
 
 		 1506 bp  54  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  88.24 
 
 		 1506 bp  54  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0070  transposase  100 
 
 		 1512 bp  52  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4455  putative transposase  100 
 
 		 1512 bp  52  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3299  integrase catalytic subunit  91.89 
 
 		 1506 bp  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  91.89 
 
 		 1506 bp  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3052  integrase catalytic subunit  91.89 
 
 		 1515 bp  50.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  91.89 
 
 		 1506 bp  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  91.89 
 
 		 1506 bp  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  91.89 
 
 		 1506 bp  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  91.89 
 
 		 1506 bp  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  91.89 
 
 		 1506 bp  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2113  Integrase catalytic region  91.89 
 
 		 1512 bp  50.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  87.5 
 
 		 1500 bp  48.1  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 1521 bp  46.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  93.55 
 
 		 1512 bp  46.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  93.55 
 
 		 1512 bp  46.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  93.55 
 
 		 1512 bp  46.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>