More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5120 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  38.15 
 
 		 1034 aa  717    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0225  CzcA family heavy metal efflux protein  48.18 
 
 		 1040 aa  961    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  37.22 
 
 		 1034 aa  678    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  49.16 
 
 		 1053 aa  1022    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  48.97 
 
 		 1048 aa  981    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  49.3 
 
 		 1070 aa  1013    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  38.89 
 
 		 1032 aa  694    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  38.48 
 
 		 1033 aa  704    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  49.72 
 
 		 1077 aa  1009    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3995  CzcA family heavy metal efflux protein  45.78 
 
 		 1047 aa  925    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4384  CzcA family heavy metal efflux protein  46.53 
 
 		 1047 aa  939    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.55849  normal  0.35087 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3984  CzcA family heavy metal efflux protein  50.55 
 
 		 1069 aa  1017    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.544325  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  49.16 
 
 		 1048 aa  980    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0387  CzcA family heavy metal efflux protein  47.6 
 
 		 1051 aa  959    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  50.56 
 
 		 1064 aa  1010    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2607  CzcA family heavy metal efflux protein  55.64 
 
 		 1061 aa  1098    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0578707  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1959  putative RND efflux system protein  46.89 
 
 		 1038 aa  939    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0614  CzcA family heavy metal efflux protein  49.82 
 
 		 1069 aa  1017    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  49.67 
 
 		 1077 aa  1004    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  49.25 
 
 		 1053 aa  1004    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  49.58 
 
 		 1077 aa  1003    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  39.71 
 
 		 1455 aa  756    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  48.5 
 
 		 1049 aa  1017    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  48.83 
 
 		 1052 aa  1005    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  48.56 
 
 		 1054 aa  1003    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  39.08 
 
 		 1036 aa  661    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  49.4 
 
 		 1062 aa  999    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  39.08 
 
 		 1029 aa  730    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  49.06 
 
 		 1053 aa  1019    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3413  RND divalent metal cation efflux transporter CnrA  55.11 
 
 		 1082 aa  1160    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4154  CzcA family heavy metal efflux protein  48.71 
 
 		 1046 aa  973    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  37.25 
 
 		 1032 aa  652    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  49.72 
 
 		 1077 aa  1009    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3369  CzcA family heavy metal efflux protein  48.65 
 
 		 1060 aa  964    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  37.73 
 
 		 1038 aa  643    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  50.27 
 
 		 1075 aa  1020    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4462  CzcA family heavy metal efflux protein  39.41 
 
 		 1446 aa  748    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0143  heavy metal efflux pump CzcA  39.94 
 
 		 1023 aa  643    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.609125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  48.13 
 
 		 1059 aa  1008    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1457  heavy metal efflux pump CzcA  48.52 
 
 		 1066 aa  954    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.40317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3933  CzcA family heavy metal efflux protein  37.97 
 
 		 1459 aa  705    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  49.72 
 
 		 1077 aa  1009    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  38.27 
 
 		 1045 aa  662    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  47.05 
 
 		 1047 aa  954    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  49.12 
 
 		 1062 aa  974    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  51.45 
 
 		 1061 aa  1006    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  49.72 
 
 		 1050 aa  1032    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  49.53 
 
 		 1070 aa  1014    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  49.3 
 
 		 1048 aa  987    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  38.25 
 
 		 1034 aa  712    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  38.67 
 
 		 1028 aa  667    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  35.84 
 
 		 1065 aa  642    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2382  CzcA family heavy metal efflux protein  42.44 
 
 		 1040 aa  732    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34537  normal  0.0621249 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2095  heavy metal efflux pump CzcA  44.64 
 
 		 1037 aa  914    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  48.32 
 
 		 1051 aa  991    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  38.69 
 
 		 1040 aa  690    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  37.02 
 
 		 1019 aa  668    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2108  heavy metal efflux pump CzcA  46.6 
 
 		 1058 aa  931    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  50.52 
 
 		 1077 aa  1024    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  41.13 
 
 		 1022 aa  684    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7181  heavy metal efflux pump CzcA  50.37 
 
 		 1062 aa  991    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7263  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  49.81 
 
 		 1060 aa  1001    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.24626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  49.57 
 
 		 1061 aa  985    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2146  heavy metal efflux pump CzcA  63.31 
 
 		 1083 aa  1380    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.580962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  49.58 
 
 		 1070 aa  1013    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  48.12 
 
 		 1043 aa  991    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  47.68 
 
 		 1038 aa  959    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  38.3 
 
 		 1031 aa  697    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  48.43 
 
 		 1054 aa  1013    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  48.7 
 
 		 1040 aa  1011    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  49.44 
 
 		 1046 aa  988    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  48.98 
 
 		 1083 aa  1011    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  48.75 
 
 		 1062 aa  976    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  49.12 
 
 		 1070 aa  1015    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  50.05 
 
 		 1070 aa  1022    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  49.58 
 
 		 1056 aa  1024    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4188  heavy metal efflux pump CzcA  39.16 
 
 		 1026 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809737 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3457  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  48.52 
 
 		 1038 aa  969    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.230333  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  36.97 
 
 		 1032 aa  710    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  49.36 
 
 		 1069 aa  1031    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  48.28 
 
 		 1072 aa  985    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  55.26 
 
 		 1079 aa  1146    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  36.82 
 
 		 1028 aa  646    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  48.45 
 
 		 1063 aa  1002    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  38.77 
 
 		 1456 aa  721    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6145  proton antiporter cation efflux protein NccA  85.5 
 
 		 1076 aa  1833    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6210  heavy metal efflux pump CzcA  86.89 
 
 		 1076 aa  1897    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339725  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  38.75 
 
 		 1023 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  49.95 
 
 		 1043 aa  1031    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3868  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA (cation efflux system protein CzcA)  47.74 
 
 		 1044 aa  976    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11693  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.11 
 
 		 1481 aa  712    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  48.22 
 
 		 1040 aa  985    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  49.16 
 
 		 1053 aa  1022    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  49.67 
 
 		 1077 aa  1004    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  49.67 
 
 		 1077 aa  1004    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2449  heavy metal efflux pump CzcA  55.83 
 
 		 1075 aa  1134    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31010  putative cation efflux system protein  47.8 
 
 		 1045 aa  960    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160016  unclonable  6.07631e-21 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2569  heavy metal efflux pump CzcA  55.08 
 
 		 1078 aa  1135    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.819785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2579  heavy metal efflux pump CzcA  61 
 
 		 1081 aa  1327    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.820402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  49.58 
 
 		 1070 aa  1013    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>