22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5030 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_5030  protein of unknown function DUF1173  100 
 
 		 441 aa  906    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5361  hypothetical protein  33.58 
 
 		 409 aa  196  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0691141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5425  hypothetical protein  31.25 
 
 		 451 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5585  hypothetical protein  30.91 
 
 		 410 aa  189  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6249  hypothetical protein  32.63 
 
 		 408 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6533  hypothetical protein  31.28 
 
 		 408 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1568  hypothetical protein  30.66 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5232  hypothetical protein  30.42 
 
 		 406 aa  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4289  hypothetical protein  26.67 
 
 		 433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4991  hypothetical protein  26.32 
 
 		 489 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  hitchhiker  0.00100031 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4238  hypothetical protein  25.25 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2244  hypothetical protein  25.12 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1564  hypothetical protein  23.82 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144406  normal  0.0475856 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4748  hypothetical protein  25.93 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4329  hypothetical protein  24.73 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00310641  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2564  hypothetical protein  24.19 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4154  hypothetical protein  22.61 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0603844  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1674  hypothetical protein  25.74 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.252915 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3958  hypothetical protein  22.26 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6826  hypothetical protein  24.18 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0336179  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4994  hypothetical protein  22.22 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6244  hypothetical protein  24.13 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>