30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4322 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4212  putative lipoprotein signal peptide  100 
 
 		 190 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4322  lipoprotein signal peptide  100 
 
 		 190 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00684015 
 
 
-
 
NC_003296  RS05425  lipoprotein signal peptide  66.14 
 
 		 175 aa  198  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3920  lipoprotein signal peptide  42.45 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  36.36 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0756  periplasmic protein  35.66 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  36.27 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  35.96 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  31.25 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  35.96 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  36.52 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  36.52 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  36.52 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  32.08 
 
 		 161 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  32.76 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.771279 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  32.76 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  32.76 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3377  protein of unknown function Spy-related  30 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  31.9 
 
 		 161 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  31.9 
 
 		 161 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  31.9 
 
 		 156 aa  48.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  31.03 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  31.03 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  27.42 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2226  hypothetical protein  29.57 
 
 		 160 aa  45.1  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0677  hypothetical protein  32.08 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000364222  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  26.03 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000285493  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  28.35 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000126692  unclonable  0.0000000242912 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0363  hypothetical protein  28.03 
 
 		 180 aa  41.6  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3274  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  41.2  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0409837  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>