86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2588 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2588  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase protein  100 
 
 		 337 aa  682    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2998  putative 2-dehydro-3-deoxygalactonokinase protein  99.41 
 
 		 337 aa  678    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296432  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2759  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase protein  94.26 
 
 		 331 aa  633  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245127  normal  0.540885 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3778  putative 2-dehydro-3-deoxygalactonokinase protein  66.67 
 
 		 345 aa  460  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.585219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4620  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  37.82 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0235772 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3534  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  31.51 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00123  2-oxo-3-deoxygalactonate kinase  33.66 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3954  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  25.57 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.940601 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0962  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  32.16 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3690  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  33.84 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0937  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  32.16 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4804  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  31.06 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0138053  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2605  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  28.89 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1015  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  28.71 
 
 		 335 aa  75.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0586  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  28.12 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0942826  normal  0.0399726 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0618  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  28.12 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313039  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0135  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  28.12 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0150281  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2246  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  31.82 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.279182  hitchhiker  0.00000435705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3414  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  26.39 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302272  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0023  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  25.26 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2068  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  27.72 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.195031 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0743  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  25.09 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3700  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  26.9 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0519  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  27.65 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2767  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  27.57 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.922315 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0543  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  27.65 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.436571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0939  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  33.33 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.340074  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0543  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  25.51 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0042  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  23.21 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.351596 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0881  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  33.33 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6031  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  27.8 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0444196  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2618  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  28.51 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3488  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  29.96 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0409  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  29.96 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.970472  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2489  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  29.96 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1269  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  29.96 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3451  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  29.96 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.531643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3489  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  29.96 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3296  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  29.96 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0545  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35.07 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3914  2-dehydro-3-deoxygalactonate kinase  25.61 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0112503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1987  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  30.43 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021694 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1176  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  30.26 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0392  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  32.51 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4221  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  26.35 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4114  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  26.35 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0054  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  31.16 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1242  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  28.22 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.502361  normal  0.183094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4125  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  29.63 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4163  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  26.35 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3665  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  26.48 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000857364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0007  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  26.84 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3614  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  28.22 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1422  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  29.23 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3833  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  25.56 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0898  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  24.9 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0009  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  24.25 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0009  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  24.25 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3906  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  24.25 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2177  2-dehydro-3-deoxygalactonate kinase  29.21 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.075101  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0502  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  32.84 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0028  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  27.23 
 
 		 307 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1371  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  26.67 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2012  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  25.64 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975056  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03577  2-oxo-3-deoxygalactonate kinase  23.88 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3489  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  31.82 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4203  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  23.77 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03521  hypothetical protein  23.88 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.225897  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0038  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  26.44 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0437  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  27.64 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51340  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  28.5 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4059  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  23.77 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0949  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  25.42 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03672  hypothetical protein  25 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03723  putative conserved protein  25 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1097  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  23.38 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4213  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  25 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226475 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2598  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  27.86 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2872  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  25.25 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4929  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  25.48 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1287  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  30.91 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0108847 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3594  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  27.14 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.943632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0845  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  25.59 
 
 		 305 aa  49.7  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3530  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  27.61 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2748  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  26.24 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6942  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  27.01 
 
 		 380 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000967621  normal  0.967512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>