21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0427 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0427  lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 305 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0412  putative lipoprotein transmembrane  92.79 
 
 		 305 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0534  lipoprotein transmembrane  73.41 
 
 		 298 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.26607  normal  0.145458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3594  hypothetical protein  47.85 
 
 		 299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2036  putative lipoprotein transmembrane  41.69 
 
 		 335 aa  241  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000209555 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1671  putative signal peptide transmembrane protein  39.16 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.505557  normal  0.644124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2779  putative signal peptide transmembrane protein  38.57 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0265643  normal  0.1742 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1277  hypothetical protein  38.91 
 
 		 323 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000935938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1766  hypothetical protein  38.91 
 
 		 336 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000723457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0129  hypothetical protein  38.91 
 
 		 336 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000566472  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4673  hypothetical protein  41.83 
 
 		 305 aa  222  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0103539 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1533  hypothetical protein  41.83 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1780  hypothetical protein  39.62 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0149316  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1801  hypothetical protein  39.62 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00434642  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1053  hypothetical protein  41.83 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1509  hypothetical protein  41.83 
 
 		 305 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.728748  hitchhiker  0.000463306 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1956  hypothetical protein  38.23 
 
 		 323 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0000000113781  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1455  hypothetical protein  40 
 
 		 306 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1415  hypothetical protein  40.56 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2530  hypothetical protein  40.39 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2255  protein of unknown function DUF1571  23.4 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>