16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0087 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0230  hypothetical protein  86.17 
 
 		 1197 bp  729    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0079  low temperature requirement A  97.23 
 
 		 1194 bp  1465    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0087    100 
 
 		 831 bp  1647    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1595  low temperature requirement A  92.31 
 
 		 1113 bp  107  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.622684  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1756  low temperature requirement A  90.7 
 
 		 1191 bp  107  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3709  low termperature growth protein  91.55 
 
 		 1191 bp  93.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.848697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1638  low temperature requirement A  90.62 
 
 		 1134 bp  79.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2245  low temperature requirement A  92.59 
 
 		 1191 bp  75.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5396  hypothetical protein  80.37 
 
 		 1203 bp  69.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2001  low temperature requirement A  85.92 
 
 		 756 bp  61.9  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2023  low temperature requirement A  88.89 
 
 		 1191 bp  60  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1597    86.15 
 
 		 1159 bp  58  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0326  low temperature requirement A  92.68 
 
 		 1227 bp  58  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697028  normal  0.0510824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1068  low temperature requirement A  92.5 
 
 		 1194 bp  56  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0159  low temperature requirement A  88 
 
 		 885 bp  52  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  96.43 
 
 		 1401 bp  48.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>