23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4098 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4098  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  721    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000500149  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1116  hypothetical protein  37.22 
 
 
346 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1476  hypothetical protein  35.07 
 
 
323 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00768599  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0779  hypothetical protein  33.43 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308749  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3551  hypothetical protein  32.14 
 
 
258 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2837  hypothetical protein  30.77 
 
 
332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.602267  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1471  hypothetical protein  32.65 
 
 
340 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3703  hypothetical protein  28.75 
 
 
351 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4502  hypothetical protein  25.89 
 
 
334 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2938  hypothetical protein  29.18 
 
 
347 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2707  hypothetical protein  27.14 
 
 
362 aa  92.8  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000134366  hitchhiker  0.00145883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1310  hypothetical protein  32.14 
 
 
359 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2822  hypothetical protein  27.92 
 
 
341 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154965  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0375  hypothetical protein  27.87 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1479  hypothetical protein  27.67 
 
 
340 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206358  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0406  hypothetical protein  28.87 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.953246  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4786  hypothetical protein  27.46 
 
 
335 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000305274  normal  0.869518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3831  hypothetical protein  36.84 
 
 
167 aa  63.9  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0502468  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4317  hypothetical protein  27.02 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00276005  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1406  hypothetical protein  26.92 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211939  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4405  hypothetical protein  26.87 
 
 
351 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.996457  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1047  hypothetical protein  25.68 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  31.09 
 
 
336 aa  43.5  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>